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文檔簡介
1、鏈霉菌AM-7161(Streptomyces sp.AM-7161)能產(chǎn)生次級代謝產(chǎn)物美達(dá)霉素(medermycin)。美達(dá)霉素是一種聚酮類抗生素,具有潛在的抗菌抗腫瘤生物學(xué)活性。在美達(dá)霉素的生物合成基因簇中,med-ORF10基因是一個功能未知基因,前期研究推測其參與美達(dá)霉素合成的調(diào)控作用。本文圍繞med-ORF10基因的調(diào)控機制展開初步研究,具體包括以下幾個方面:
1.med-ORF10對靶基因的表達(dá)調(diào)控
2、 前期半定量PCR實驗已初步得出med-ORF10對同一基因簇中的酮基還原酶編碼基因med-ORF12存在一定的調(diào)控作用。在這里我們利用實時熒光定量PCR進(jìn)一步量化其調(diào)控效果:選取了美達(dá)霉素基因簇異源表達(dá)菌株CH999/pIK340(異源野生菌株)和敲除了med-ORF10的突變菌株CH999/pAYT64(異源突變菌株),提取兩者的總RNA,將其反轉(zhuǎn)錄為cDNA,以看家基因23S rRNA基因作為內(nèi)參,利用實時熒光定量PCR檢測“異
3、源野生菌株”和“異源突變菌株”中med-ORF12基因的轉(zhuǎn)錄水平變化。實驗結(jié)果表明,med-ORF12在“異源突變菌株”中較“異源野生菌株”轉(zhuǎn)錄水平下降了約5倍,這與前期推測med-ORF10為一正調(diào)控基因相符,表明此基因在美達(dá)霉素合成基因簇中行使著重要的調(diào)控作用。
2.med-ORF10基因的原核表達(dá)和抗體制備
為了能進(jìn)一步研究med-ORF10的調(diào)控機制,我們對med-ORF10基因進(jìn)行原核表達(dá)和多克隆抗
4、體的制備。
首先從含有美達(dá)霉素合成全基因簇的pIK340質(zhì)粒上PCR得到med-ORF10基因,將其克隆到pT7Blue載體上,亞克隆至表達(dá)載體pET28a(+)上,轉(zhuǎn)化至表達(dá)菌株BL21(DE3)中,構(gòu)建了原核表達(dá)系統(tǒng)BL21(DE3)/pHSL79。優(yōu)化誘導(dǎo)表達(dá)條件獲得高表達(dá)的可溶性Med-ORF10蛋白,大量純化Med-ORF10蛋白,將純化的Med-ORF10蛋白多次免疫新西蘭大白兔和昆明小鼠制備多克隆抗體,通過W
5、esternblot檢測抗體的特異性較高。
3.研究Med-ORF10蛋白與靶基因啟動子的相互作用
前期實驗表明,med-ORF10基因是一個正效轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因,調(diào)節(jié)的靶基因之一為med-ORF12,且調(diào)控效果非常明顯,但具體調(diào)控機制也還未確定。我們試圖通過凝膠遷移阻滯實驗(EMSA)檢測Med-ORF10蛋白是否與med-ORF12的啟動子區(qū)域直接結(jié)合發(fā)揮其調(diào)控作用。
首先得到med-ORF12
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