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1、隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的迅猛發(fā)展,應(yīng)用高性能計(jì)算和一些新的算法進(jìn)行分子模擬的研究已經(jīng)成為一個(gè)新的研究方向。耗散分子動(dòng)力學(xué)(DissipativeParticle Dynamic DPD)作為一種分子模擬的重要方法和工具已經(jīng)在化工理論研究和化學(xué)實(shí)驗(yàn)中起到了很重要的作用。但是DPD模擬需要的計(jì)算量比較大,因此隨著計(jì)算的粒子數(shù)的增加其計(jì)算時(shí)間和負(fù)載度增長(zhǎng)較快,所以將DPD程序并行化,應(yīng)用一些并行算法對(duì)DPD程序改造,可以縮短計(jì)算時(shí)間,提高計(jì)算效率。<
2、br> 本文采用空間劃分算法,使用MPICH將DPD程序并行化,2節(jié)點(diǎn)并行加速比達(dá)到1.635,8節(jié)點(diǎn)達(dá)到5.8。另外由于傳統(tǒng)DPD方法不能處理氣體液體分相,因此不能模擬像動(dòng)態(tài)潤(rùn)濕現(xiàn)象等當(dāng)今很多熱點(diǎn)問(wèn)題,本論文在相關(guān)理論指導(dǎo)下將DPD程序改為多體耗散分子動(dòng)力學(xué)方法(Many-body Dissipative Particle Dynamics MDPD),并且用一個(gè)毛細(xì)管潤(rùn)濕的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證MDPD程序的正確性。并且為了提高計(jì)算效率,本
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