miR-214通過靶定Plexin-B1抑制腫瘤細胞的運動和增殖能力.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的: MicroRNA(miRNA)是一類新發(fā)現(xiàn)的能夠調控其靶基因表達水平的小RNA分子家族。近幾年已經發(fā)現(xiàn)并確定了上千種miRNA,目前miRNA的功能研究正日益成為生物學一個非?;钴S的研究領域。本研究旨在結合生物信息學、基因芯片及報告基因技術預測和確定miR-214在人類腫瘤細胞中的靶基因,并對miR-214通過調控靶基因而在腫瘤細胞中發(fā)揮的生物學功能進行進一步研究。 方法: 利用miRNA芯片技術對幾種

2、不同組織來源腫瘤細胞系中miR-214的表達水平進行比較,隨后在使用miR-214反義寡聚核苷酸特異性抑制細胞內miR-214功能后,利用MTT法和軟瓊脂克隆形成實驗篩選分析miR-214對腫瘤細胞活性和增殖能力的影響。在此基礎上結合靶基因預測程序和mRNA表達譜芯片以及半定量RT-PCR的結果對miR-214的靶基因進行預測和篩選,并通過檢測GFP報告基因的方法進行驗證。隨后根據已知的該靶基因功能,應用腫瘤細胞運動能力實驗和測定生長曲

3、線的方法確定miR-214對腫瘤細胞運動能力和增殖能力的調控作用。 結果: 通過對miRNA芯片結果的分析發(fā)現(xiàn)在人類腫瘤細胞系HT-29,HeLa,MCF-7,A549,K562,ES-2中miR-214的表達都保持在較一致的水平。隨后利用MTI法和軟瓊脂克隆形成實驗對miR-214的功能進行篩選分析,發(fā)現(xiàn)在HeLa細胞中miR-214功能受到抑制后腫瘤細胞的活性和增殖能力均明顯增強。 在此基礎上利用長寡聚核苷酸

4、基因芯片(共7267個人類基因,包含凋亡相關基因、腫瘤相關基因、信號轉導相關基因、肝酶代謝相關基因、細胞因子相關基因)分析抑制miR-214的功能后mRNA表達譜的變化,選取部分表達有差異基因經過半定量RT-PCR驗證,最終得到與芯片結果相符的基因有四個:Plexin-B1,MDH1,COX5A和RAC1。其中Plexin-B1是靶基因預測程序分析后認定的miR-214可能靶位點,在miR-214的功能被抑制后表達升高,我們通過檢測GF

5、P報告基因的方法確定了miR-214可以通過與Plexin-B13'UTR預測靶位點區(qū)域的直接相互作用抑制報告基因GFP的表達。 隨后,根據已知的該靶基因功能,一方面通過測定生長曲線確定了miR-214對腫瘤細胞增殖能力的抑制作用,另一方面利用腫瘤細胞趨化性運動能力實驗,證明了miR-214可以通過靶定:Plexin-B1而抑制腫瘤細胞的運動能力。 結論: 本文預測并首次確定了Plexm-B1是miR-214在人

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