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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:探討核苷酸切除途徑中著色性干皮病基因 C(XPC)和著色性干皮病基因 F(XPF)單核苷酸多態(tài)性及單倍型與胰腺癌患病的關(guān)聯(lián)性。
方法:本研究采用以醫(yī)院為基礎(chǔ)的病例-對(duì)照研究設(shè)計(jì),收集新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院和第三附屬醫(yī)院2009年1月至2011年6月期間收治214例胰腺癌病例。并按照性別、民族、年齡±5歲匹配,收集正常對(duì)照人群214例。并收集他們的血樣標(biāo)本和臨床資料(一般特征、吸煙史、個(gè)人史、家族中的腫瘤史等)。篩選XP
2、C基因rs3731055、rs2607775、rs3729587、rs2228000、rs2228001、rs3731114和rs2470353位點(diǎn)和XPF基因rs254942和rs3136038共9個(gè)位點(diǎn)為候選SNP位點(diǎn),使用全血基因組DNA快速提取試劑盒提取 DNA,采用 SnaPshot單核苷酸多態(tài)性分析技術(shù)對(duì)所收集的血樣標(biāo)本進(jìn)行基因分型檢測(cè)。使用卡方檢驗(yàn)、單因素logistic回歸分析、多元logistic回歸分析等方法,分析基
3、因多態(tài)性與胰腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)。
結(jié)果:
第一部分:胰腺癌病例組與正常對(duì)照組比較,兩組在吸煙、飲酒、生育、糖尿病、家族腫瘤史等方面,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。在單因素logistic回歸分析顯示,吸煙≥17包年(OR=2.258,95%CI:1.105~4.614)和重度以上飲酒(OR=9.118,95%CI:1.128~73.73)可能增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。在多因素logistic回歸分析顯示,吸煙≥17包
4、年是影響胰腺癌發(fā)病的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.87,95%CI:1.234~6.66,P=0.014)。
第二部分:成功基因分型423例血樣標(biāo)本。胰腺癌病例組攜帶XPC基因SNP2(rs2607775)次要等位基因G和基因型C/G、G/G的的頻率高于對(duì)照組。兩組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.005,P=0.014)。攜帶XPC基因rs2607775 G/C基因型比攜帶C/C基因型個(gè)體增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(
5、校正OR=1.81,95%CI:1.06~3.10,P=0.03)。在顯性遺傳模型下,攜帶至少一個(gè)突變基因G的個(gè)體(G/C+G/G vs C/C)增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正 OR=1.98,95%CI:1.16~3.36,P=0.011)。胰腺癌病例組攜帶XPC基因SNP7(rs2470353)次要等位基因C和基因型G/C,C/C的頻率高于正常對(duì)照組,兩組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.005,P=0.014)。攜帶rs2470353
6、G/C基因型個(gè)體比攜帶 G/G基因型個(gè)體增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR=1.81,95%CI:1.06~3.10,P=0.030)。在顯性遺傳模型下,攜帶至少一個(gè)突變基因C的個(gè)體增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR=1.98,95%CI:1.16~3.36,P=0.011)。XPC其他5個(gè)SNP未發(fā)現(xiàn)與胰腺癌遺傳易感性相關(guān)。XPC基因型與環(huán)境的交互作用顯示,未發(fā)現(xiàn)吸煙≥17包年與XPC基因SNP2,SNP7存在交互作用,影響胰腺癌的發(fā)病率。在
7、XPC基因中構(gòu)建9種單倍型。與攜帶單倍體Hap1-GGGCGCC個(gè)體比較,攜帶單倍體Hap5-TGGCGCC的個(gè)體降低胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR=0.30,95%CI:0.11~0.84,P=0.022)。攜帶單倍型Hap7-TCACGGC的個(gè)體明顯增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR=10.68,95%CI:1.24~91.77,P=0.032)。
第三部分:胰腺癌病例組攜帶XPF基因SNP1(rs3136038)次要等位基因T和
8、基因型C/C的頻率高于正常對(duì)照組,兩組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.009,P=0.005)。與攜帶 XPF基因rs3136038 C/C基因型個(gè)體比較,攜帶T/C基因型個(gè)體增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR=2.03,95%CI:1.35~3.07,P=7.34E~04)。經(jīng)多重檢驗(yàn)校正,在超顯性遺傳模型下,攜帶C/T基因型的個(gè)體增加胰腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR=2.00,95%CI:1.33~3.00,P=0.031)。XPF基因rs25
9、4942的多態(tài)性未發(fā)現(xiàn)與胰腺癌的遺傳易感性有關(guān)聯(lián)性。同時(shí)在XPF基因中構(gòu)建出2種單體型,以單倍體Hap1-CA為參考,攜帶單倍體Hap2-TA個(gè)體增加胰腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR=1.66,95%CI:1.16~2.37,P=0.005)。在XPF基因型與環(huán)境的交互作用顯示,吸煙與XPF基因SNP1(rs3136038)存在交互作用。在吸煙≥17包年的個(gè)體中,攜帶 C/T基因型比攜帶 C/C基因型和T/T基因型增加胰腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(校正OR
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