肝細(xì)胞癌中DNA甲基化調(diào)控miRNA表達(dá)的研究.pdf

1、肝細(xì)胞癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）是世界范圍內(nèi)的第五大惡性腫瘤，因?yàn)槿狈τ行У闹委熓侄?，其致死率在癌癥中占第三位。為了發(fā)展新的有效干預(yù)手段，亟需對(duì)其分子機(jī)制進(jìn)行深入研究。越來(lái)越多的研究表明，microRNAs（miRNAs），一種非編碼小RNA，在肝細(xì)胞癌中經(jīng)常表達(dá)失調(diào)并通過(guò)在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控抑癌基因或者原癌基因的表達(dá)而在肝細(xì)胞癌中發(fā)揮重要作用。目前miRNA表達(dá)失調(diào)的機(jī)制還不完全清楚，但DNA甲基化被認(rèn)

2、為是關(guān)鍵的調(diào)控方式之一。因此，在本研究中，我們通過(guò)整合分析全基因組范圍內(nèi)miRNA的DNA甲基化數(shù)據(jù)與表達(dá)譜數(shù)據(jù)研究DNA甲基化與miRNA表達(dá)的相關(guān)性。在3株肝細(xì)胞癌細(xì)胞株和原代正常肝細(xì)胞中構(gòu)建miRNA的DNA甲基化譜，并通過(guò)肝細(xì)胞癌細(xì)胞株和原代正常肝細(xì)胞的比較分析獲得分布于236個(gè)miRNAs上的864個(gè)差異甲基化區(qū)域。對(duì)差異甲基化區(qū)域進(jìn)行深入分析，我們發(fā)現(xiàn)DNA低甲基化在基因組上分布更廣泛而DNA高甲基化傾向發(fā)生在CpG島區(qū)域。

3、比較分析7株肝細(xì)胞癌細(xì)胞株和原代正常肝細(xì)胞的miRNA表達(dá)譜，我們得到37個(gè)在肝細(xì)胞癌中表達(dá)失調(diào)的miRNA，其中10個(gè)miRNA可能受到DNA甲基化的調(diào)控。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，miR-148a與它的兩個(gè)靶標(biāo)基因DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT1和DNMT3B形成一個(gè)負(fù)反饋調(diào)控環(huán)。另外，我們推斷miR-195/497簇不僅僅受它自身啟動(dòng)子區(qū)域的高甲基化的調(diào)控，同時(shí)也受到高甲基化的轉(zhuǎn)錄因子NEUROG2和DDIT3的調(diào)控。最后，我們提出一種模式解釋D