肝細胞癌中DNA甲基化調(diào)控miRNA表達的研究.pdf

1、肝細胞癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）是世界范圍內(nèi)的第五大惡性腫瘤，因為缺乏有效的治療手段，其致死率在癌癥中占第三位。為了發(fā)展新的有效干預(yù)手段，亟需對其分子機制進行深入研究。越來越多的研究表明，microRNAs（miRNAs），一種非編碼小RNA，在肝細胞癌中經(jīng)常表達失調(diào)并通過在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控抑癌基因或者原癌基因的表達而在肝細胞癌中發(fā)揮重要作用。目前miRNA表達失調(diào)的機制還不完全清楚，但DNA甲基化被認

2、為是關(guān)鍵的調(diào)控方式之一。因此，在本研究中，我們通過整合分析全基因組范圍內(nèi)miRNA的DNA甲基化數(shù)據(jù)與表達譜數(shù)據(jù)研究DNA甲基化與miRNA表達的相關(guān)性。在3株肝細胞癌細胞株和原代正常肝細胞中構(gòu)建miRNA的DNA甲基化譜，并通過肝細胞癌細胞株和原代正常肝細胞的比較分析獲得分布于236個miRNAs上的864個差異甲基化區(qū)域。對差異甲基化區(qū)域進行深入分析，我們發(fā)現(xiàn)DNA低甲基化在基因組上分布更廣泛而DNA高甲基化傾向發(fā)生在CpG島區(qū)域。

3、比較分析7株肝細胞癌細胞株和原代正常肝細胞的miRNA表達譜，我們得到37個在肝細胞癌中表達失調(diào)的miRNA，其中10個miRNA可能受到DNA甲基化的調(diào)控。進一步分析發(fā)現(xiàn)，miR-148a與它的兩個靶標(biāo)基因DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT1和DNMT3B形成一個負反饋調(diào)控環(huán)。另外，我們推斷miR-195/497簇不僅僅受它自身啟動子區(qū)域的高甲基化的調(diào)控，同時也受到高甲基化的轉(zhuǎn)錄因子NEUROG2和DDIT3的調(diào)控。最后，我們提出一種模式解釋D