2006-2007年狂犬病毒野毒株L基因3′端及聚合酶活性部位序列分析.pdf

1、狂犬病是由狂犬病病毒所引起的一種烈性人獸共患傳染病。近年來，廣西狂犬病對人民的生命安全造成了嚴重的威脅?，F(xiàn)在已經(jīng)做了許多分子流行病學的研究，以便更好地了解狂犬病毒的進化。本研究對廣西11株狂犬病毒L基因的3′端和聚合酶活性部位進行了克隆和序列分析。然后將所得序列和實驗室保存毒株序列一起與國內(nèi)外公開發(fā)表的狂犬固定毒、狂犬相關(guān)病毒的序列對應部分進行序列比較。結(jié)果表明，廣西毒株之間同源性較高，3′端的核苷酸和氨基酸同源性分別為85.6％-10

2、0.0％和92.0％-100.0％，聚合酶活性部位的核苷酸和氨基酸同源性分別為88.8％-100.0％和97.5％-100.0％。與狂犬固定毒、狂犬相關(guān)病毒比較，3′端核苷酸和氨基酸同源性分別為67.5％-96.8％和70.4％-99.1％，聚合酶活性部位核苷酸和氨基酸同源性分別為76.8％-97.8％和94.0％-100.0％。分析氨基酸序列變異位點發(fā)現(xiàn)，3′端突變主要發(fā)生在2、17、19、48、73、74、93、136和161位點；

3、聚合酶活性部位突變主要發(fā)生在49、63、72、108、136、145和157位，而且在117-122位點存在嚴格保守的核心序列“AQGDNQ”。 對本研究野毒株的L基因3′端和聚合酶活性部位的序列分析結(jié)果表明，廣西毒株之間親緣關(guān)系近，與狂犬固定毒親緣關(guān)系較遠，與狂犬相關(guān)病毒最遠。據(jù)遺傳進化分析，所有廣西毒株均屬于基因Ⅰ型。本研究毒株在實驗室保存毒株已經(jīng)分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三個群的基礎(chǔ)上可以并入已有群，具有群一致性。其中GXQZD、GX