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文檔簡介
1、遼寧絨山羊是我國特有的禁止基因外流的寶貴遺傳資源,產(chǎn)絨量居全國第一。在前期工作中,我們通過建庫及Primer walking質(zhì)粒測通的方法克隆篩選出蛋白脂質(zhì)蛋白質(zhì)基因(proteolipid protein2,PLP2)的全長序列。為了探究該基因的功能,我們對其進行了生物信息學分析(包括預測其開放閱讀框,親疏水性分析、跨膜預測分析、信號肽預測分析、磷酸化位點預測分析、二級結(jié)構(gòu)預測、進化樹的構(gòu)建、多重序列的比對、保守結(jié)構(gòu)域搜索),Real
2、-time PCR,RT-PCR,原位雜交以及Noggin基因干擾慢病毒感染后目的基因的qPCR檢測等的一系列分析研究。
分析結(jié)果顯示:首先,通過生物信息學分析,我們發(fā)現(xiàn)PLP2基因能夠編碼含有152個氨基酸的蛋白質(zhì),二級結(jié)構(gòu)預測顯示,PLP2基因含有α螺旋結(jié)構(gòu)(46.05%)、延伸結(jié)構(gòu)(12.5%)和無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)(41.45%),功能位點分析顯示,PLP2含有MARVEL結(jié)構(gòu)域并且存在4個跨膜區(qū),不存在信號肽,PLP2氨基酸
3、含有3個Ser、2個Tyr和1個Thr可能成為蛋白激酶磷酸化位點;其次,通過RT-PCR檢測顯示,PLP2基因在皮膚、心臟、肝臟、腎臟、肺、脾臟中均有表達,且表達差異不是很明顯,其中皮膚中的表達含量相對較高;同時,還運用了熒光定量PCR技術,定量的檢測其在不同時期的表達情況,發(fā)現(xiàn)在興盛期時,PLP2基因在次級毛囊的表達量約為初級毛囊的1.02倍(0.01<P<0.05),在退行期時,PLP2基因的表達量仍是次級毛囊高于初級毛囊,是初級毛
4、囊的1.16倍(0.01<P<0.05);另外,經(jīng)過原位雜交分析,發(fā)現(xiàn)PLP2基因在內(nèi)根鞘有表達,而在外根鞘、毛干(角質(zhì)層、皮層和髓層)以及毛囊乳突中無表達;最后,通過Noggin基因干擾后PLP2基因的qPCR檢測,顯示空白組的表達量是NC陰性對照的1.15倍,而noggin干擾后PLP2的表達量是NC陰性對照組的0.64倍。
結(jié)論:(1) PLP2基因在皮膚、心臟、肝臟、腎臟、肺、脾臟各個組織中都有表達,這說明PLP2與各
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