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文檔簡介
1、目的:初步篩選靶向DPC4的miRNA,并探討此miRNA對DPC4的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控作用及分子機(jī)制。
方法:結(jié)合基因芯片結(jié)果,利用生物信息學(xué)方法篩選出可能靶向DPC4基因的miRNA; Real-time PCR檢測五種大腸癌細(xì)胞miRNA和DPC4基因的表達(dá),westem-blot檢測DPC4蛋白表達(dá)情況,選擇miRNA/DPC4比值最大的細(xì)胞株作為后續(xù)轉(zhuǎn)染對象;分別合成針對miR-190的mlmics和inhibitor,瞬時
2、導(dǎo)入所選出的大腸癌細(xì)胞株中,采用real-time PCR和western-blot檢測DPC4的表達(dá):使用psiCHECKTM-2載體,分別合成含miR-190可能靶向位點(diǎn)的DPC4/SMAD43′UTR片段的野生型及突變型雙熒光光素酶報告基因,將mimics-190和陰性對照分別與兩種質(zhì)粒組合共轉(zhuǎn)染入工具細(xì)胞293T中,使用Promega檢測系統(tǒng)對轉(zhuǎn)染后細(xì)胞雙熒光素酶活性檢測,計算相對熒光素酶活性并進(jìn)行分析。
結(jié)果:使用預(yù)
3、測軟件TargetScan、microRNA.org和mIRecords,預(yù)測miR-190可能對DPC4mRNA3'UTR有直接的調(diào)控作用;熒光定量PCR分析了miR-190和DPC4基因的在五種大腸癌細(xì)胞系的表達(dá)情況,選取了表達(dá)較穩(wěn)定的miR-190及miRNA/DPC4比值最大的大腸癌細(xì)胞株HT-29作為后續(xù)研究對象;使用real-time PCR和western-blot檢測mimics和inhibitors瞬時轉(zhuǎn)染后miR-1
4、90和DPC4的表達(dá),結(jié)果顯示miR-190mimics和inhibitor成功導(dǎo)入細(xì)胞,并且與各自陰性對照組相比,mimics組細(xì)胞DPC4蛋白表達(dá)水平下降,inhibitor組上升,而RNA水平無明顯變化;雙熒光素酶活性檢測系統(tǒng)檢測轉(zhuǎn)染后細(xì)胞雙熒光素酶活性,發(fā)現(xiàn)與陰性對照相比,miR-190可抑制psiCHECK-2TMvector-3'UTR的熒光素酶報告基因活性。
結(jié)論:
1.DPC4基因是miRNA-190
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