ABCG1、ABCA1基因多態(tài)性與中國(guó)人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)性研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、本文從以下幾個(gè)部分展開(kāi)論述:
  第一部分 ABCG1、ABCA1基因多態(tài)性與中國(guó)人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)性研究
  目的:缺血性腦卒中(Ischemic stroke,IS)是一類由環(huán)境和遺傳因素共同作用的復(fù)雜疾病,動(dòng)脈粥樣硬化(Atherosclerosis,AS)是其重要病理基礎(chǔ)。三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體A1(ATP binding cassette transporter A1,ABCA1)和三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體G1(

2、ATP binding cassette transporter G1,ABCG1)與AS發(fā)生密切相關(guān)。本課題探討ABCG1、ABCA1基因多態(tài)性與中國(guó)人群IS的關(guān)聯(lián)性。
  方法:采用病例-對(duì)照研究設(shè)計(jì),隨機(jī)選取符合研究標(biāo)準(zhǔn)的360名IS病人為病例組和358名健康人群為對(duì)照組,所選病例組根據(jù)TOAST分型標(biāo)準(zhǔn)分為兩個(gè)亞組:大動(dòng)脈粥樣硬化型(Large artery atherosclerosis,LAA)和小動(dòng)脈閉塞型(Smal

3、l artery occlusion,SAO)。采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Polymerase chain reaction-Restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)和直接測(cè)序法對(duì)五個(gè)單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn)(ABCG1rs1378577、rs2234714、rs57137919、rs225374和

4、ABCA1rs2230806)進(jìn)行基因分型。采用擬合優(yōu)度的卡方檢驗(yàn)分析Hardy-Weinberg遺傳平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)。采用SHESIS在線軟件對(duì)所選SNPs計(jì)算D’值與r2值,進(jìn)行連鎖不平衡檢驗(yàn),應(yīng)用Phase2.1軟件構(gòu)建單體型。采用logistic回歸模型分析5個(gè)SNPs及其與年齡、性別、吸煙、飲酒、高血壓病史和糖尿病史等傳統(tǒng)危險(xiǎn)因素交互作用及基因-基因交互作用對(duì)IS的影響。采用

5、廣義線性模型分析與IS相關(guān)的SNPs對(duì)血脂的影響。
  結(jié)果:1、五個(gè)SNPs在病例組和對(duì)照組中均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),表示所選人群具有代表性。2、ABCG1的rs57137919G/A和rs2234714G/A、ABCA1rs2230806G/A與IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)降低有關(guān),分別以rs57137919GG和rs2234714GG基因型為參照,相應(yīng)的GA與GA、AA與AA基因型能顯著降低IS的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),O

6、R(95%CI)分別為0.48(0.35,0.66)與0.53(0.37,0.75)、0.23(0.14,0.39)與0.36(0.23,0.56),P值均<0.001,以rs2230806GG基因型為參照,AA基因型可降低65%的IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<0.001);亞組分析發(fā)現(xiàn),rs57137919G/A可顯著降低LAA和SAO的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<0.05),rs2234714G/A與rs2230806G/A均可顯著降低LAA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<

7、0.001),但與SAO無(wú)顯著相關(guān)性(P>0.05);ABCG1rs225374C/G主要與LAA的易感性降低有關(guān),與C等位基因相比,G等位基因可顯著降低27%的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P=0.027);未觀察到ABCG1的rs1378577A/C與IS的顯著易感性(P>0.05)。3、ABCG1四個(gè)SNPs(順序?yàn)閞s1378577、rs2234714、rs57137919和rs225374)單體型頻率比較,以AAAG單體型為參照,AAGG、AGG

8、C和CGGC單體型攜帶者IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加至2.25、3.86和2.55倍,P值分別為0.025、<0.001和0.005。4、SNP-rs57137919與吸煙交互作用對(duì)IS的影響有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,與吸煙組相比,在不吸煙組中rs57137919對(duì)IS的影響顯著低于吸煙組,OR(95%CI)分別為0.5(0.38,0.67)和0.21(0.09,0.5)(Pinteraction=0.036)。5、rs2230806G/A和rs225374C

9、/G的交互作用與IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)(Pinteraction=0.002)。6、rs57137919G/A、rs2234714G/A、rs225374C/G和rs2230806G/A在病例組和對(duì)照組中均可顯著提高高密度脂蛋白(High density lipoprotein,HDL)水平(P<0.05)。
  結(jié)論:1、ABCG1SNPrs57137919G/A、rs2234714G/A和ABCA1rs2230806G/A可能與中國(guó)

10、漢族人群IS的易感性降低有關(guān),ABCG1rs225374C/G可能主要與LAA的易感性降低有關(guān),而ABCG1rs1378577A/C可能與IS發(fā)病無(wú)相關(guān)性;2、位于ABCG1上的四個(gè)SNPs所構(gòu)成的單體型與IS的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān);3、ABCG1rs57137919G/A、rs225374C/G、rs2234714G/A和ABCA1rs2230806G/A可顯著提高HDL水平,提示其可能通過(guò)調(diào)節(jié)HDL水平,進(jìn)而降低IS的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn);4、ABCG

11、1rs57137919G/A與吸煙有交互作用,可共同影響IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn);5、ABCG1與ABCA1的基因-基因交互作用可共同影響IS發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
  第二部分 ABCA1基因R219K多態(tài)性與中國(guó)人群缺血性腦卒中風(fēng)險(xiǎn):匯總分析
  目的:系統(tǒng)評(píng)價(jià)ABCA1基因R219K多態(tài)性與中國(guó)人群缺血性腦卒中(Ischemic stroke,IS)的關(guān)聯(lián)性。
  方法:通過(guò)全面文獻(xiàn)檢索收集2013年5月以前發(fā)表的中國(guó)人群ABCA1基因

12、R219K多態(tài)性與IS相關(guān)性的病例對(duì)照研究,剔除不符合要求文獻(xiàn)。匯總分析采用Stata11.0統(tǒng)計(jì)軟件,利用OR及其95%CI評(píng)價(jià)基因多態(tài)與IS的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度,繪制漏斗圖,并采用Begg’s和Egger’s回歸來(lái)評(píng)價(jià)發(fā)表偏倚。
  結(jié)果:共10個(gè)研究符合條件納入分析,包括病例組1619例,對(duì)照組1907例,入選文獻(xiàn)無(wú)明顯偏倚。匯總分析結(jié)果顯示,顯性模型(OR=0.92,95%CI:0.88-0.96,P=0.000);隱性模型(OR=

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