利用EST-CAPS標(biāo)記構(gòu)建桉樹遺傳圖譜.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文以尾葉桉和細(xì)葉桉兩親本及其雜交產(chǎn)生的124個子代為材料，運用EST-CAPS標(biāo)記構(gòu)建了桉樹的遺傳框架圖譜。從GenBank共下載4037條桉樹EST序列，拼接以后得到了3095條獨立序列，并對2500條獨立序列設(shè)計了PCR引物，在母本尾葉桉中能夠成功擴(kuò)增的有1684條。本研究利用6種限制性內(nèi)切酶，對622條擴(kuò)增產(chǎn)物長度大于400bp的EST進(jìn)行了CAPS酶切多態(tài)性篩選，得到了能在作圖群體中產(chǎn)生等位片段多態(tài)性的61個EST；同時，結(jié)合

2、前期開發(fā)的12個EST-CAPS標(biāo)記，共有73個標(biāo)記進(jìn)行了作圖分析。研究結(jié)果如下：
　　(1)對73個EST的酶切結(jié)果的?2檢驗(?=0.05)表明，24個標(biāo)記是偏分離的，偏分離比率為32.9％。由于標(biāo)記數(shù)量較少，所以將所有的標(biāo)記都用于作圖分析。
　　(2)分別用Mapmaker3.0、JoinMap4.0、FsLinkageMap1.0三個軟件進(jìn)行了標(biāo)記連鎖分析。用Mapmaker3.0在LOD為3.0的情況下，構(gòu)建的圖譜

3、長度為537.3cM，有48個標(biāo)記連鎖成18個連鎖群，連鎖群內(nèi)標(biāo)記數(shù)為2-5個。用JoinMap4.0在LOD不小于3的情況下，構(gòu)建的圖譜長度為654.0cM，有49個標(biāo)記連鎖成18個連鎖群，連鎖群內(nèi)標(biāo)記數(shù)為2-6個。用FsLinkageMap1.0在LOD為3的條件下，構(gòu)建的圖譜長度為993.4cM，有63個標(biāo)記連鎖成17個連鎖群，連鎖群內(nèi)標(biāo)記數(shù)為2-10個。比較三個軟件的分析結(jié)果，用Mapmaker3.0構(gòu)建的圖譜與用JoinMap

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