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文檔簡介
1、在我國,胃癌的發(fā)病率很高,由于胃癌篩查沒有得到普及和重視,大多數(shù)胃癌到中晚期才得到診斷,化療仍是主要的治療手段。但是腫瘤原發(fā)或繼發(fā)性耐藥的產(chǎn)生致使腫瘤對化療不敏感,最終導(dǎo)致治療的失敗。多年來對耐藥相關(guān)基因功能的研究揭示了眾多的耐藥機制,在指導(dǎo)臨床治療中逐漸顯示出重要的作用,然而由于這些基因之間相互缺乏聯(lián)系,因而所進行的研究也相對獨立。近年來研究顯示一類長度為21~25nt的單鏈非編碼微小RNA(microRNA)在腫瘤發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重
2、要的作用。生物信息學(xué)顯示microRNA通過調(diào)節(jié)不同的基因而發(fā)揮重要的生物學(xué)效應(yīng),從而使一些看似相互獨立的基因之間建立了緊密的聯(lián)系。在腫瘤耐藥方面,研究顯示相同microRNA能夠通過調(diào)控不同的靶點而影響腫瘤細胞對抗腫瘤藥物的敏感性。在胃癌化療臨床藥物的選擇中,順鉑(cisplatin,CDDP)仍是基礎(chǔ)化療藥物之一。SGC7901/CDDP是胃癌順鉑耐藥的細胞株。雖然已有一些關(guān)于其耐藥機制的報道,但是目前尚未有對該細胞的microRN
3、A表達譜特征的報道,同時microRNA在胃癌順鉑耐藥過程中所起的作用也沒有深入的研究。本研究對SGC7901/CDDP細胞的耐藥特性進行了分析;對SGC7901/CDDP及其親代順鉑敏感的SGC7901細胞進行microRNA表達譜的高通量篩選,通過與SGC7901細胞microRNA的表達譜進行對比,篩選出其中差異表達的microRNA,并應(yīng)用靶點預(yù)測軟件進行靶點預(yù)測及生物信息學(xué)分析,尋找潛在的microRNA靶點或調(diào)控通路,以期改
4、善胃癌細胞的耐藥問題。在建立SGC7901/CDDP細胞microRNA表達譜的基礎(chǔ)上,進一步探討了microRNA-200c對胃癌SGC7901/CDDP細胞耐藥及增殖的影響,并觀察了其對E-cadherin、PTEN/Akt通路及凋亡蛋白Bcl-2和BAX的調(diào)控作用。同時通過抑制高表達E-cadherin的SGC7901細胞中E-cadherin的表達,觀察細胞的耐藥性和增殖能力的改變和PTEN/Akt通路及凋亡蛋白Bcl-2和BA
5、X的變化,分析E-cadherin對細胞耐藥和增殖的影響及其機制,探討E-cadherin是否介導(dǎo)了microRNA-200c對PTEN/Akt通路及凋亡蛋白的間接調(diào)控。
第一部分胃癌SGC7901/CDDP細胞microRNA表達譜及其生物信息學(xué)分析
目的:研究SGC7901/CDDP細胞的耐藥特性,通過對比SGC7901/CDDP耐藥細胞與親代細胞microRNA表達譜的差異,嘗試在microRNA水平尋
6、找到胃癌細胞耐藥的機制和改善耐藥的潛在治療靶點。
方法:采用MTT法檢測SGC7901/CDDP及SGC7901細胞對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的藥物敏感性;采用microRNA芯片檢測兩株細胞的microRNA表達譜并進行比對篩選出差異表達的microRNA;對異常表達的microRNA分別應(yīng)用TargetScan(http://www.targetscan.org/)及MicroCosm Targets Ver
7、sion5(http://www.ebi.ac.uk/enright-srv/microcosm/htdocs/targets/v5/)預(yù)測microRNA靶點,并進行比對后篩選出兩種方法均能預(yù)測到的共同的靶點;同時根據(jù)靶點所對應(yīng)的microRNA表達改變情況將靶點分為microRNA表達降低組和microRNA表達增高組。對microRNA表達降低組和microRNA表達增高組的靶點進一步采用Blast2GO進行在線批量GO分析(ht
8、tp://www.blast2go.org/start_blast2go),對靶點的生物學(xué)進程進行注釋,預(yù)測microRNA參與的生物學(xué)功能。
結(jié)果:
1 兩株細胞對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的敏感性:不同濃度的順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇作用48h后,SGC7901/CDDP及SGC7901兩株細胞的存活率不同。SGC7901/CDDP細胞對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的IC50分別為:
9、11.245±0.272mg/L、0.763±0.043mg/L、12.154±2.036mg/L和3.277±0.426mg/L;SGC7901細胞對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的IC50分別為:2.206±0.256mg/L、0.229±0.020mg/L、4.481±0.544mg/L和1.528±0.097mg/L。與SGC7901細胞相比,SGC7901/CDDP對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的IC50均顯著高于S
10、GC7901細胞(P<0.05),SGC7901/CDDP對四種抗腫瘤藥物的敏感性降低。
2 RNA的質(zhì)量檢測:從SGC7901/CDDP及SGC7901細胞提取出總RNA的濃度分別為:1145.77mg/L和1853.74mg/L,A260/A280值均在1.9~2.0之間,從甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果來看。其18S和28S條帶清晰,亮度比約為1:2,總RNA純度達到實驗要求且無明顯降解。
3 microR
11、NA芯片檢測結(jié)果:經(jīng)Hy3熒光標記、純化,進行芯片雜交,圖像采集,數(shù)據(jù)進行歸一化處理后,以兩種細胞Hy3熒光標記信號強度的比值≤0.5或≥2為標準判定差異表達microRNA。結(jié)果顯示:與SGC7901細胞相比,SGC7901/CDDP細胞中表達下調(diào)超過2倍的microRNA有14個,分別為:microRNA-33a、microRNA-200c、microRNA-302c*、microRNA-488、microRNA-148a、micr
12、oRNA-141、microRNA-212、microRNA-576-3p、microRNA-660、microRNA-338-3p、microRNA-24-1*、microRNA-589、microRNA-887和microRNA-22*;表達上調(diào)超過2倍的microRNA有5個,分別為:microRNA-1246、microRNA-943、microRNA-1290、microRNA-516a-5p和microRNA-34b。
13、> 4 microRNA預(yù)測靶點的生物信息學(xué)分析結(jié)果:microRNA表達降低組共有451個預(yù)測靶點,Blast2GO分析顯示這些靶點參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、蛋白質(zhì)磷酸化、跨膜轉(zhuǎn)運、藥物敏感性、細胞周期、分化、凋亡、增殖、粘附、DNA修復(fù)等生物學(xué)進程。microRNA表達增高組共有98個預(yù)測靶點,Blast2GO分析顯示這些靶點參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、跨膜轉(zhuǎn)運、細胞周期、凋亡、增殖、分化、組織發(fā)生等生物學(xué)進程。
結(jié)論
14、:
1 與親代胃癌SGC7901細胞比較,胃癌SGC7901/CDDP細胞除了對順鉑耐藥性顯著增高外,其對阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的耐藥性也出現(xiàn)增加,呈現(xiàn)出多藥耐藥的表型。
2 通過利用microRNA芯片篩選出胃癌順鉑耐藥SGC7901/CDDP細胞及其親本SGC7901細胞之間差異表達的microRNAs,其中microRNA-33a、microRNA-200c、microRNA-302c*、micr
15、oRNA-488、microRNA-148a、microRNA-141、microRNA-212等14個microRNAs在SGC7901/CDDP細胞中表達下調(diào)、microRNA-1246、microRNA-943、microRNA-1290、microRNA-516a-5p、microRNA-34b在SGC7901/CDDP細胞中表達上調(diào)。
3 通過對這些異常改變microRNA的預(yù)測靶點進行GO分析,提示這些異常表達
16、的microRNA具有復(fù)雜的生物學(xué)效應(yīng),表明多個microRNA參與了SGC7901/CDDP細胞的多藥耐藥。
第二部分 microRNA-200c對胃癌SGC7901/CDDP細胞耐藥和增殖的影響
目的:microRNA-200c是我們在上一部分實驗中通過microRNA芯片篩選出的SGC7901/CDDP耐藥細胞與親代SGC7901細胞表達差異的microRNA。本部分實驗試圖進一步驗證microRNA芯
17、片篩選的結(jié)果,同時通過改變microRNA-200c的表達探索其對SGC7901/CDDP細胞藥物敏感性及增殖所起的作用。
方法:采用實時熒光定量PCR對microRNA芯片篩選出的microRNA-200c的表達水平進行驗證;采用siPORTTM NeoFXTM Transfection Agent將microRNA-200c前體(pre-200c)或陰性對照序列轉(zhuǎn)染到SGC7901/CDDP細胞中,轉(zhuǎn)染24h后提取細胞
18、總RNA采用實時熒光定量PCR檢測microRNA-200c表達水平的改變;采用MTT法檢測轉(zhuǎn)染后的SGC7901/CDDP細胞對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇敏感性的改變;采用細胞計數(shù)法檢測轉(zhuǎn)染后的SGC7901/CDDP細胞體外增殖能力的改變。
結(jié)果:
1 microRNA-200c在兩株細胞中表達的差異:實時熒光定量PCR結(jié)果顯示;SGC7901/CDDP細胞microRNA-200c的△Ct為15
19、.470±0.036,SGC7901細胞的△Ct為14.657±0.229。SGC7901/CDDP細胞microRNA-200c的相對表達水平是SGC7901細胞的0.573±0.084倍,顯著低子敏感株細胞的表達(P<0.05)。
2 SGC7901/CDDP細胞轉(zhuǎn)染24h后microRNA-200c的表達改變:實時熒光定量PCR結(jié)果顯示SGC7901/CDDP細胞轉(zhuǎn)染pre-200c24h后microRNA-200c
20、的△Ct為12.660±0.079,陰性對照組△Ct為15.493±0.080。細胞轉(zhuǎn)染pre-200c24h后microRNA-200c相對表達水平是陰性對照組的7.128±0.159倍(P<0.05)。
3 microRNA-200c對SGC7901/CDDP細胞耐藥性的影響:轉(zhuǎn)染pre-200c后的SGC7901/CDDP細胞增加了對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇的敏感性。IC50分別為:7.518±0.186m
21、g/L、0.381±0.053mg/L、7.267±0.090mg/L及1.705±0.332mg/L;陰性對照組分別為:12.180±0.294mg/L、0.721±0.034mg/L、11.534±0.598mg/L及3.140±0.403mg/L。兩者差異顯著(P<0.05)。
4 microRNA-200c對SGC7901/CDDP細胞增殖能力的影響:轉(zhuǎn)染pre-200c的SGC7901/CDDP細胞接種后從第3天
22、開始細胞數(shù)目顯著低于陰性對照組(P<0.05),增殖能力顯著降低。
結(jié)論:
1 通過實時熒光定量PCR證實microRNA-200c在胃癌順鉑耐藥細胞株SGC7901/CDDP中表達下調(diào),驗證了microRNA芯片的結(jié)果。
2 上調(diào)microRNA-200c的表達能顯著增加SGC7901/CDDP細胞在體外對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇四種抗腫瘤藥物的敏感性,發(fā)揮化療增敏作用。
23、 3 上調(diào)microRNA-200c的表達能顯著抑制SGC7901/CDDP細胞的體外增殖能力。
第三部分 microRNA-200c逆轉(zhuǎn)SGC7901/CDDP細胞耐藥及抑制增殖的分子機制
目的:為了明確microRNA-200c逆轉(zhuǎn)SGC7901/CDDP細脆耐藥及抑制增殖的分子機制,我們試圖通過分析SGC7901/CDDP耐藥細胞與親代SGC7901細胞一些相關(guān)蛋白E-cadherin、PTEN、p-
24、Akt、Akt、Bcl-2和BAX表達的差異,以及microRNA-200c表達增加后這些蛋白表達水平的變化,尋找microRNA-200c調(diào)控的相關(guān)蛋白及使SGC7901/CDDP細胞發(fā)生耐藥的效應(yīng)蛋白。
方法:采用Western blot法檢測SGC7901/CDDP及SGC7901細胞中E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白表達差異;采用siPORTTM NeoFXTM Trans
25、fection Agent將pre-200c或陰性對照序列轉(zhuǎn)染到SGC7901/CDDP細胞中,轉(zhuǎn)染后72h提取細胞總蛋白,采用Western blot法檢測轉(zhuǎn)染后的SGC7901/CDDP細脆E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白表達的改變。
結(jié)果:
1 兩株細胞中E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白表達:SGC7901/CDDP細胞
26、E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白的相對表達量分別為:0.098±0.030、0.178±0.064、1.019±0.093、1.181±0.102、0.267±0.018和0.215±0.026;SGC7901細胞E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白的相對表達量分別為:0.467±0.061、874±0.056、0.166±0.017、1.231±0.163
27、、0.108±0.011和0.366±0.017。與SGC7901細胞相比,SGC7901/CDDP細胞中p-Akt和Bcl-2蛋白的相對表達量顯著增高(P<0.05),而E-cadherin、PTEN和BAX蛋白的相對表達量顯著降低(P<0.05),總Akt的相對表達量在兩組之間未見顯著差異(P>0.05)。
2 microRNA-200c對SGC7901/CDDP細胞E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、
28、Bcl-2和BAX蛋白表達的影響:SGC7901/CDDP細胞轉(zhuǎn)染pre-200c后E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白的相對表達量分別為:0.471±0.010、0.589±0.016、0.220±0.035、1.255±0.116、0.074±0.008和0.380±0.008;陰性對照組的E-cadherin、PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白的相對表達量分別為:0.109±
29、0.002、0.111±0.002、0.687±0.086、1.291±0.117、0.442±0.020和0.111±0.005。轉(zhuǎn)染pre-200c組細胞的E-cadherin、PTEN、BAX蛋白的相對表達量顯著高于陰性對照組(P<0.05),而p-Akt及Bcl-2蛋白的表達顯著低于陰性對照組(P<0.05),總Akt的相對表達量在兩組之間未見顯著差異(P>0.05)。
結(jié)論:
1 SGC7901/C
30、DDP細胞耐藥表型與E-cadherin、PTEN及BAX蛋白表達的下降、Akt通路激活和Bcl-2蛋白的表達增加有關(guān)。
2 microRNA-200c對SGC7901/CDDP細胞耐藥逆轉(zhuǎn)和增殖抑制的作用與誘導(dǎo)E-cadherin、PTEN及BAX蛋白的表達、抑制Akt通路的激活和下調(diào)Bcl-2蛋白的表達有關(guān)。
第四部分 E-cadherin siRNA對SGC7901細胞耐藥與增殖的影響及分子機制研究
31、r> 目的:前一部分的研究結(jié)果提示microRNA-200c參與調(diào)控一系列耐藥相關(guān)蛋白,為了進一步探討microRNA-200c與這些蛋白以及這些蛋白彼此之間的信號傳導(dǎo)順序,我們根據(jù)其它研究的結(jié)果,研究E-cadherin是否介導(dǎo)了從microRNA-200c傳導(dǎo)下來的調(diào)控信息,同時探討E-cadherin對SGC7901細胞耐藥和增殖的影響。
方法:采用Lipofectamine2000將E-cadherin si
32、RNA或其陰性對照序列轉(zhuǎn)染到SGC7901細胞中,轉(zhuǎn)染后24、48、72h分別提取細胞總蛋白采用Western blot檢測轉(zhuǎn)染后細胞的E-cadherin蛋白的抑制效率;SGC7901細胞轉(zhuǎn)染24h后采用MTT法檢測轉(zhuǎn)染后的SGC7901細胞對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇敏感性的改變,采用細胞計數(shù)法檢測轉(zhuǎn)染后的SGC7901細胞體外增殖能力的改變;SGC7901細胞轉(zhuǎn)染72h后提取細胞的總蛋白,采用Western blot檢測轉(zhuǎn)
33、染后細胞的PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白表達的改變。
結(jié)果:
1 SGC7901細胞轉(zhuǎn)染后的E-cadherin蛋白表達改變:SGC7901細胞轉(zhuǎn)染E-cadherin siRNA24、48和72h后E-cadherin蛋白的相對表達量分別為:0.244±0.006、0.155±0.007和0.118±0.014,陰性對照組為0.527±0.006,轉(zhuǎn)染E-cadherin siRNA后
34、E-cadherin蛋白的表達受到顯著抑制(P<0.05)。
2 SGC7901細胞轉(zhuǎn)染E-cadherin siRNA后對化療藥物敏感性的改變:轉(zhuǎn)染E-cadherin siRNA后的SGC7901細胞降低了對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶和紫杉醇的敏感性。IC50分別為:4.375±0.199mg/L、0.368±0.042mg/L、6.855±0.780mg/L和2.530±0.259mg/L;陰性對照組分別為:2.88
35、2±0.166mg/L、0.228±0.012mg/L、4.058±0.946mg/L和1.483±0.225mg/L。兩組差異顯著(P<0.05)。
3 E-cadherin siRNA對SGC7901細胞增殖能力的影響:轉(zhuǎn)染E-cadherin siRNA的SGC7901細胞接種后從第4天開始細胞數(shù)目顯著高于陰性對照組(P<0.05),細胞的增殖能力顯著增強。
4 E-cadherin siRNA對SGC
36、7901細胞PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白表達的影響:轉(zhuǎn)染E-cadherin siRNA72h后SGC7901細胞的PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白的相對表達量分別為:0.148±0.010、0.455±0.034、1.045±0.182、0.328±0.014和0.139±0.013;轉(zhuǎn)染陰性對照序列72h后SGC7901細胞的PTEN、p-Akt、Akt、Bcl-2和BAX蛋白的相對表達量
37、分別為:0.531±0.014、0.224±0.049、1.158±0.143、0.114±0.012和0.369±0.016。轉(zhuǎn)染E-cadherin siRNA72h后SGC7901細胞的p-Akt和Bcl-2蛋白的相對表達量顯著高于陰性對照組,而PTEN和BAX蛋白的相對表達量顯著低于對照組(P<0.05),總Akt的相對表達量在兩組之間未見顯著差異(P>0.05)。
結(jié)論:
1 抑制E-cadheri
38、n的表達能顯著降低SGC7901細胞在體外對順鉑、阿霉素、5-氟脲嘧啶及紫杉醇四種抗腫瘤藥物的敏感性,增強了細胞對化療藥物的耐受。
2 抑制E-cadherin的表達能顯著改變SGC7901細胞的體外增殖能力,導(dǎo)致細胞增殖能力增加。
3 抑制E-cadherin表達導(dǎo)致的SGC7901細胞耐藥和增殖與下調(diào)PTEN及BAX蛋白的表達、激活A(yù)kt信號通路和上調(diào)Bcl-2蛋白的表達有關(guān)。
4 在胃癌細
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