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文檔簡介
1、目的:研究CHRNA55’側(cè)翼區(qū)的多態(tài)與中國人群肺癌的易感性關(guān)聯(lián),以及其的分子生物學(xué)功能,包括多態(tài)位點對基因5’側(cè)翼區(qū)的轉(zhuǎn)錄活性的影響和對轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合能力的影響。
方法:本研究采用病例一對照的方法,采用SNapShot技術(shù)在505例肺癌病例和498例健康對照中進行了分型分析。檢測到單倍型對CHRNA5側(cè)翼區(qū)轉(zhuǎn)錄活性的影響用雙螢光素酶報告基因法檢測。以及不同單倍型對核蛋白的結(jié)合能力的影響采用表面等離子共振技術(shù)進行檢測。
2、 結(jié)果:基因型分析結(jié)果顯示,攜帶rs503464 TA基因型的個體患肺癌的風(fēng)險顯著降低(P=0.003,OR=0.637,95%CI=0.472-0.858)。對這個位點進一步的基因-環(huán)境互作分層分析表明,與純合子基因型(TT+AA)攜帶者比較,(TA)基因型的保護效應(yīng)在年齡>60歲[校正OR=0.496(0.339-0.726)],無腫瘤家族史[校正OR=0.591(0.450-0.777)]更顯著。此外,在我們進行單倍型分析,觀察到
3、由多態(tài)單rs3829787C>T and rs3841324 ins>del所組成的兩個單倍型T/ins和C/del對肺癌的發(fā)病具有很強的保護效應(yīng)[校正OR=0.61(0.44-0.85)和OR=0.33(0.19-0.57)],雖然在單位點的關(guān)聯(lián)分析中,此兩個多態(tài)位點對于肺癌的風(fēng)險性都沒有呈現(xiàn)出顯著的保護作用。在之后的雙螢光素酶檢測系統(tǒng)中,我們發(fā)現(xiàn)這兩個對肺癌起保護作用的單倍型具有完全相反的轉(zhuǎn)錄活性:即單倍型T/ins具有最高的轉(zhuǎn)錄活
4、性,而單倍型C/del卻具有最低的轉(zhuǎn)錄活性。之后的表面等離子共振技術(shù)證實了,兩個多態(tài)位點的高頻等位基因(-1640C或-62ins)相對于低頻等位基因(-1640T或-62del)來說,對于A549細(xì)胞的核提取物都具有更強的結(jié)合能力。
結(jié)論:高轉(zhuǎn)錄活性與低轉(zhuǎn)錄活性的單倍型(T/ins和C/del對于肺癌都呈現(xiàn)出顯著的保護作用。而處于中間轉(zhuǎn)錄活性的單倍型(C/ins和T/del)對于肺癌的風(fēng)險性沒有顯著的關(guān)聯(lián)性。這提示我們一個更
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