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1、目的:全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)報(bào)道,人類(lèi)第15號(hào)染色體長(zhǎng)臂15q24-25區(qū)域上編碼煙堿型乙酰膽堿受體的候選基因簇即尼古丁受體家族(CHRNA3-CHRNA5-CHRNB4,CHRNA3/5)與吸煙行為導(dǎo)致肺部疾病密切相關(guān)。據(jù)報(bào)道,CHRNA3基因啟動(dòng)子區(qū)的一個(gè)遺傳突變位點(diǎn)rs6495309(T>C)是中國(guó)人群特有,分布頻率較高,且與吸煙人群肺部疾病發(fā)生關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)。本研究探討吸煙人群中尼古丁受體3(CHRNA3)基因啟動(dòng)子區(qū)的基因多
2、態(tài)性與吸煙相關(guān)的慢性阻塞性肺疾病(COPD)和肺癌易感性的關(guān)系。
方法:采用病例-對(duì)照研究方法,分別收集60例吸煙COPD患者,60例吸煙肺癌患者,40例吸煙COPD合并肺癌患者和60例吸煙健康者,采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)檢測(cè)CHRNA3基因啟動(dòng)子單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)rs6495309(T>C)的基因型,用SPSS13.0軟件進(jìn)行非條件Logistic回歸校正混雜因素的影響,分析基因變異與
3、吸煙者的COPD、肺癌以及COPD合并肺癌的發(fā)病情況。
結(jié)果:⑴CHRNA3的rs6495309(T>C)突變基因型與吸煙COPD患者:rs6495309TT、rs6495309TC和rs6495309CC三個(gè)基因型在吸煙COPD組與吸煙健康組中的分布差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P=0.043。CHRNA3 rs6495309的CC基因型與吸煙者COPD的易感性相關(guān)(P=0.014),且在男性吸煙人群中,rs6495309的CC基
4、因型與COPD的相關(guān)性更明顯,攜帶CC基因型的吸煙男性個(gè)體患COPD是TT型個(gè)體的4.22倍(OR=4.222,95%CI為1.369-13.02,P=0.012),而TC基因型與COPD無(wú)相關(guān)性。而且隨著吸煙指數(shù)的增加rs6495309的CC基因型在COPD患者中占得比例越高。但進(jìn)一步根據(jù)COPD發(fā)病嚴(yán)重程度進(jìn)行分析可得,rs6495309的CC基因型在Ⅲ、Ⅳ級(jí)COPD人群與Ⅰ、Ⅱ級(jí)COPD人群的差異沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,即rs649530
5、9的CC基因型與COPD嚴(yán)重程度不相關(guān)。⑵基因型頻率均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。三個(gè)基因型在吸煙肺癌組與吸煙健康組的分布差異有統(tǒng)計(jì)意義,P=0.006,且攜帶CC基因型吸煙個(gè)體發(fā)生肺癌的危險(xiǎn)性是TT基因型個(gè)體的5.5倍,OR=5.500,95%CI=1.813-16.681。rs6495309C變異的基因型患肺癌的危險(xiǎn)性增加(P=0.002,OR=2.250,95%CI=1.342-3.771)。根據(jù)性別
6、進(jìn)行分層分析,發(fā)現(xiàn)男性吸煙人群中,rs6495309C與肺癌的易感性相關(guān)(TC:OR=3.261,95%CI=1.103-9.637,P=0.033;CC:OR=6.333,95%CI=1.874-21.402,P=0.003)。進(jìn)一步分析得攜帶rs6495309C突變的吸煙個(gè)體與鱗癌和腺癌的發(fā)病具有相關(guān)性,且與疾病的嚴(yán)重程度相關(guān)。而其與小細(xì)胞肺癌和其他病理類(lèi)型無(wú)關(guān)。⑶三個(gè)基因型在吸煙COPD合并肺癌組與吸煙健康組的分布差異沒(méi)有統(tǒng)計(jì)意義
7、,P=0.179,rs6495309C等位基因在吸煙COPD合并肺癌的組和吸煙健康組的基因頻率分布差異沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,說(shuō)明CHRNA3 rs6495309(T>C)突變與COPD合并肺癌的發(fā)生無(wú)相關(guān)性。rs6495309C基因突變?cè)贑OPD合并不同病理類(lèi)型的肺癌中,也無(wú)相關(guān)性。
結(jié)論:①CHRNA3基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性與吸煙男性的COPD易感性低度相關(guān),與吸煙女性COPD無(wú)相關(guān)性,且隨著吸煙的嚴(yán)重程度的增加,突變基因型的分布
8、頻率越高,但CHRNA3基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)與COPD的嚴(yán)重程度沒(méi)有相關(guān)性。②CHRNA3基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性與吸煙人群的肺癌易感性相關(guān),但該位點(diǎn)SNP變化與鱗癌和腺癌相關(guān),與小細(xì)胞肺癌和其他類(lèi)型肺癌不相關(guān),但其與與肺癌的嚴(yán)重程度相關(guān),可以作為篩選吸煙人群鱗癌、腺癌的生物標(biāo)記物和吸煙晚期肺癌患者的預(yù)測(cè)指標(biāo)。③吸煙人群中,CHRNA3基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性與COPD合并肺癌的易感性不相關(guān)。④吸煙與CHRNA3 rs6495309C突變可能存在環(huán)境-
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