鯉TRIM47生物特性初步探究及SVCV感染斑馬魚轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析.pdf

1、SVC是由SVCV引起的一種重要的病毒性傳染疾病，可引起多種鯉科魚類嚴(yán)重的出血癥狀以及死亡現(xiàn)象，給養(yǎng)殖業(yè)造成了重大損失。TRIM家族蛋白具有多種生物學(xué)功能，其抗病毒活性引起較多關(guān)注。本研究擬從天然免疫角度探究TRIM47對SVCV的作用，以及采用RNA測序手段探究SVCV與其宿主的相互作用機(jī)制，為發(fā)現(xiàn)更多SVCV靶標(biāo)奠定的理論基礎(chǔ)。具體研究內(nèi)容如下:
　　一、鯉TRIM47生物特性分析及功能初步探究
　　1)對TRIM47的

2、序列特征進(jìn)行比對和聚類分析，以及對鯉TRIM47的時空分布進(jìn)行檢測;
　　2)體外SVCV感染可以顯著抑制TRIM47 mRNA水平，但不影響TRIM47蛋白水平;
　　3) TRIM47體外真核表達(dá)呈均勻點(diǎn)狀分布在細(xì)胞質(zhì)，亞細(xì)胞定位顯示TRIM47部分定位在線粒體上;
　　4)過表達(dá)TRIM47可以顯著抑制SVCV-G mRNA的合成，在SVCV刺激下可顯著上調(diào)IFN1 mRNA水平。
　　二、SVCV感染斑馬

3、魚轉(zhuǎn)錄組分析
　　1)模擬自然感染的溫度條件，將水溫控制在17℃，斑馬魚腹腔注射SVCV，獲得了良好的感染模型;
　　2) SVCV感染斑馬魚轉(zhuǎn)錄組分析，在腦中檢測到382個差異基因、脾中926個差異基因;
　　3) SVCV感染斑馬魚后GO富集到Biological process、 Cellular component和Molecular function三類生物過程;
　　4) KEGG信號通路分析結(jié)果顯示