狼瘡易感基因PBX1單核苷酸多態(tài)性的篩選分析及其功能研究.pdf

1、【目的】對(duì)中國(guó)漢族人群系統(tǒng)性紅斑狼瘡（SLE）易感基因前B淋巴細(xì)胞白血病轉(zhuǎn)錄因子（PBX1）單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行篩選分析，并探討陽(yáng)性SNPs的生物學(xué)功能。 【方法】利用Taqman技術(shù)對(duì)PBX1基因內(nèi)部29個(gè)SNPs和PBX1基因與微衛(wèi)星標(biāo)記D1S2628之間26個(gè)SNPs的243個(gè)家系樣本進(jìn)行基因分型，并用Haploview、FBAT、Genehunter軟件進(jìn)行家系連鎖不平衡分析。利用3730基因測(cè)序技術(shù)對(duì)506名正常人和

2、690名SLE患者標(biāo)本進(jìn)行rs3185695基因分型，進(jìn)行病例對(duì)照研究。通過(guò)Real-time PCR、Pyrosequencing測(cè)序技術(shù)以及報(bào)告基因活性測(cè)定等方法分析PBX1基因3’UTR區(qū)SNP rs3185695對(duì)基因表達(dá)的影響。 【結(jié)果】通過(guò)家系連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)，有4個(gè)SNP（rs1038679，rs10753646，rs2488916，rs12082970 ）與SLE存在相關(guān)性，其中rs1038679，rs1075

3、3646位于PBX1 內(nèi)含子區(qū)，rs2488916，rs12082970位于PBX1基因與微衛(wèi)星標(biāo)記D1S2628之間。中國(guó)漢族人群中rs3185695次要等位基因A在SLE患者組和正常對(duì)照組的頻率分別為11.6％和7.4％，具有顯著性差異，次要等位基因A與SLE發(fā)病相關(guān)。兩種不同等位基因在mRNA水平表達(dá)量及其重組質(zhì)粒報(bào)告基因活性存在明顯差異，提示該位點(diǎn)的變異可能影響PBX1基因表達(dá)。 【結(jié)論】認(rèn)為PBX1基因3’ UTR區(qū)的