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文檔簡介
1、目的:分子機制的比較蛋白質組學研究本研究在蛋白質組水平分析X射線誘導人腦膠質瘤細胞株MGR2放射抗拒的分子機制,旨在分析不同放射敏感性的膠質瘤細胞的蛋白質組表達差異,為預測膠質瘤放射治療反應和放療增敏研究提供依據。 采用大劑量間歇照射的方法(2Gy 3次,5Gy、8Gy和10Gy各2次)誘導人腦膠質瘤細胞系MGR2產生具有穩(wěn)定放射抗拒性的細胞亞系MGR2R52,分別測定MGR2和MGR2R52在2Gy照射后的生存率;提取MGR2
2、和MGR2R52及二者照射后繼續(xù)培養(yǎng)48h細胞的總蛋白,分別進行cydye染料標記和膠內差異雙向電泳(2D-DIGE)分離;經Typhoon 9400型多功能激光掃描儀不同波長的激光掃描后,獲取熒光膠內差異表達圖譜,繼而采用Decyder軟件進行圖譜分析;選取2D.DIGE圖譜中差異表達≥1.5倍且P值≤0.001的蛋白質斑點,通過全自動斑點處理工作站切點、酶解和點樣后,使用基質輔助激光解吸/電離-飛行時間質譜儀(MALDI-TOF M
3、S)進行蛋白質的肽指紋圖譜(PMF)鑒定。 MGR2和MGR2R52的SF<,2>分別為0.1 92和0.579(P<0.001);經DeCyder軟件分析,MGR2與MGR2R52之間共有110個蛋白點強度差異≥1.5倍,其中MGR2在誘導后有26個蛋白表達下調,84個蛋白表達增加;MGR2在照射后48h蛋白質表達無顯著變化;而MGR2R52在照射后48h有13個蛋白表達顯著增高。我們選取了75個與其他蛋白點充分分離的、邊界清
4、晰的蛋白點(有利于提高質譜的鑒定率),經質譜分析有26個蛋白點成功鑒定,共計23個蛋白包括:細胞骨架相關蛋白如Vinculin、gelsolinisoform b、Unnamed protein product和SYNE1 protein;與應激反應有關的熱休克蛋白如Heat shock 70kDa protein 4L;與RNA翻譯和蛋白質合成有關的蛋白如upstream of NRASisoform 1和Tryptophanyl-T
5、ma synthetase;細胞內吞有關的interferon-induced Mx protein和DYN2-HUMAN[AA 474-870];與糖代謝有關的 UDP-N-acteylglucosaminepyrophosphorylase 1和Triosephosphate isomerase 1;與蛋白質降解有關的ER.60 protein、ATPase(H+transporting,lysosomal 56/58kD,V1 s
6、ubunit B,isoform 2)、Proteasome activatorsubunit 2和Cathepsin D;與氧化還原有關的DERPl2(dermal papilla derived protein 12)、Biliverdin reductase A和peroxiredoxin 3 isoform b;酯酶如Esteterase D/formylglutathionehydrolase;還有MHC class Ⅰ an
7、tigen HLA-A2、KIAA0494 protein、Annexin I以及未知功能的蛋白如Hypothetical protein等。 1. MGR2R52細胞中Peroxiredoxin 3異構體b、真皮乳頭衍生蛋白12和酯酶D表達增加,增加MGR2R52細胞照射后活性氧族的清除能力,有利于MGR2R52細胞照射后的存活; 2. MGR2R52細胞的糖代謝通路發(fā)生改變,促進還原型輔酶Ⅱ NADPH的生成,增加為
8、過氧化物酶和谷胱甘肽等供氫,有利于活性氧的清除; 3. MGR2R52細胞的蛋白質合成和降解發(fā)生改變,其中溶酶體功能降低有利于減輕放射后Ⅱ型程序性死亡,而蛋白酶體通路的增強促進了細胞抗原的表達,為膠質瘤放療后聯合免疫治療提供了線索和依據; 4. MGR2R52細胞蛋白骨架增加有利于維持細胞結構功能的穩(wěn)定,為放射后的修復提供一個適宜的內環(huán)境; 5. SYNE1在MGR2R52細胞2Gy照射后48h表達增加2倍以上,
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