膀胱上皮腫瘤尿液差異蛋白的篩選.pdf

1、北京協(xié)和醫(yī)學院博士學位論文膀胱上皮腫瘤尿液差異蛋白的篩選姓名：吳昕申請學位級別：博士專業(yè)：臨床醫(yī)學指導教師：李漢忠200906013使用SPSSl60統(tǒng)計軟件對讀取的蛋白質分子峰值結果進行統(tǒng)計學分析。P005認為存在明顯統(tǒng)計學差異。4使用BPS對上述所得結果進行聚類分析，建立膀胱腫瘤的診斷篩選模型。結果：1本實驗中膀胱腫瘤患者的臨床特點：共有38例膀胱腫瘤患者進入實驗組，最小年齡35歲，最大年齡88歲，中位年齡685歲，其中60歲以上的

2、患者占了737％。其中男性27例，女性11例，男：女25：1。術后病理明確為高級別腫瘤的有17例，低級別的有19例，未明確高低級別的有2例。2SELDI質譜儀讀取樣本蛋白質分子峰值的結果：設置CiphergenProteinSoftware321顯示的最小分子量為1000，最大分子量為50000，信噪比≥5；蛋白最低出現比率5％，可以分析得到共214個可讀點。3使用SPSSl60統(tǒng)計軟件得到的統(tǒng)計結果：對所有的214個可讀點進行正態(tài)分布

3、檢驗，發(fā)現其中90個點所代表的蛋白質分子峰值在所有樣本中呈現正態(tài)分布，余124個點所代表的蛋白質分子峰值在所有樣本中不呈現正態(tài)分布。對所有符合正態(tài)分布的數據進行T檢驗分析，共發(fā)現分子量為1712263、1896238、2228543、2464589、2977719和4792879的6個蛋白質峰值在實驗組與對照組之間存在顯著差別，均符合P005。對所有不符合正態(tài)分布的數據進行非參數Mann—WhitneyU檢驗分析，共發(fā)現分子量為1877

4、678、2212175、2578946、2847638、3249263、3385764、4129112、1330409、151084、1665269、2219704和3335489的12個蛋白質峰值在實驗組與對照組之間存在顯著差別，均符合P005。4使用BPS建立膀胱腫瘤診斷篩選模型的結果：利用上述18個峰值在實驗組與對照組之間存在顯著差異的蛋白，對所有的樣本進行聚類分析。發(fā)現當依次選用2464589、1896238、1877678、2

5、977719和2847638等5個蛋白質的峰值作為分組結點建立診斷篩選模型時，可以將實驗組與對照組按照最高的正確率區(qū)分開來。5圖形分析的結果：使用CiphergenProteinSoftware321，選擇上述診斷篩選模型中的分子量為2464589的蛋白質作為示例，分別用線型圖和凝膠模擬圖觀察實驗組和對照組圖形中的差別。發(fā)現在線型圖中實驗組與對照組在分子量為2464589的蛋白點上存在峰值高低的明顯差異，而凝膠模擬圖中兩組在相同的蛋白點