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
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文檔簡介
1、目的:
胃癌是人類常見的惡性腫瘤之一,占我國目前惡性腫瘤死亡的第一位。其早期癥狀不明顯并且缺乏有效的治療措施,因此尋找新的診斷和治療靶點對胃癌的早期診斷、治療以及預后具有重要的臨床意義。DNA甲基化是調控基因表達的一種重要的表觀遺傳學過程,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育及人類腫瘤發(fā)生中起著重要作用。腫瘤細胞中DNA甲基化異常概括為基因組整體低甲基化和抑癌基因調控區(qū)域高甲基化。MicroRNA(miRNA)是真核生物中一
2、類長度約18-25個堿基的小分子非編碼RNA,腫瘤細胞中miRNA的表達受到包括DNA甲基化修飾在內的多種機制的調控,其異常表達與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及演進有著極為密切的關系。以往的研究表明miRNA-375在胃癌、食管癌等多種腫瘤中低表達,本研究應用生物信息學方法預測其基因啟動子區(qū)存在CpG島,通過檢測胃癌組織中miRNA-375基因甲基化水平及基因表達水平,探討其啟動子區(qū)CpG島甲基化改變是否參與胃癌組織中miRNA-375異常表達的調
3、控,并進一步預測胃癌中miRNA-375可能調控的靶基因,為將miRNA基因甲基化作為胃癌早期診斷及治療的靶點提供依據。
方法:
1經內鏡及手術取90例新鮮組織活檢標本,分為兩組:胃癌組54例,正常對照組36例。
2應用生物信息學進行miRNA-375基因啟動子區(qū)CpG島預測并設計甲基化特異性PCR(MSP)引物。提取基因組DNA,應用MSP檢測組織miRNA-375基因啟動子區(qū)CpG島甲基化。
4、3提取總RNA,應用實時熒光定量反轉錄PCR(real-time qRT-PCR)檢測組織miRNA-375基因表達。
4運用TargetSean Human等生物信息學方法,預測miRNA-375可能的靶基因。
結果:
1 miRNA-375基因甲基化
1.1胃癌組織中miRNA-375基因甲基化胃癌組和正常對照組miRNA-375基因甲基化陽性率分別為62.96%(34/54)和22.22%(
5、8/36),兩組相比,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
1.2 miRNA-375基因甲基化與胃癌臨床病理學特征的關系高中分化組與低分化組miRNA-375基因甲基化陽性率分別為44.44%(8/18)和72.22%(26/36),兩組相比,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。miRNA-375基因甲基化陽性率與患者性別、年齡、淋巴結轉移及臨床病理分期(TNM分期)的差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
2 miRN
6、A-375基因表達
2.1胃癌組織中miRNA-375基因的表達胃癌組miRNA-375基因的表達低于正常對照組,是其表達水平的0.148倍,兩組相比,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
2.2 miRNA-375基因表達與胃癌臨床病理學特征的關系高中分化組miRNA-375基因表達高于低分化組,是其表達水平的3.046倍,兩者相比,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。miRNA-375基因表達水平與患者性別、年齡、淋
7、巴結轉移及臨床病理分期(TNM分期)無明顯關系,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
3生物信息學分析示SP1、AHR、GATA6、KLF4等可能為miRNA-375的靶基因。
結論:
1預測miRNA-375基因啟動子區(qū)存在CpG島,并證實胃癌組織中存在miRNA-375基因啟動子區(qū)CpG島高甲基化,miRNA-375基因高甲基化與胃癌組織分化程度相關。提示miRNA-375基因啟動子區(qū)甲基化水平檢測有助
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