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文檔簡介
1、本論文主要研究了肺炎鏈球菌表面蛋白SP0498Big結(jié)構(gòu)域、釀酒酵母SWI1ARID結(jié)構(gòu)域和人SUV39H1chromo結(jié)構(gòu)域的結(jié)構(gòu)和分子作用機制。
1.肺炎鏈球菌是人類急性呼吸道感染等嚴(yán)重疾病的致病菌。我們通過NMR的方法解析了肺炎鏈球菌表面蛋白SP0498中Big(bacterialimmuno-globulin-like)結(jié)構(gòu)域的溶液結(jié)構(gòu)。SP0498Big結(jié)構(gòu)域由8條β-鏈構(gòu)成,呈桶狀結(jié)構(gòu),與經(jīng)典的免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域
2、三明治狀結(jié)構(gòu)明顯不同。有意思的是我們發(fā)現(xiàn)了SP0498Big結(jié)構(gòu)域是一個Ca2+結(jié)合結(jié)構(gòu)域,而且其結(jié)構(gòu)與已知鈣離子結(jié)合結(jié)構(gòu)域不同,所以它的發(fā)現(xiàn)揭示了一種新的鈣離子結(jié)合模塊。此外,我們還鑒定出該結(jié)構(gòu)域中可能參與鈣離子結(jié)合的關(guān)鍵殘基。我們首次從結(jié)構(gòu)方面報道了Big結(jié)構(gòu)域和鈣離子的相互作用,這說明Big結(jié)構(gòu)域可能在許多重要性、鈣離子依賴的細(xì)胞過程,如細(xì)菌的致病過程中都具有重要作用。
2.SWI1是釀酒酵母中染色體重塑SWI/SN
3、F的一個亞基。SWI1具有一個ARID(AT-richinteractiondomain)結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域具有潛在的DNA結(jié)合活性。我們通過NMR的方法解析了釀酒酵母中SWI1ARID結(jié)構(gòu)域的溶液結(jié)構(gòu)。該結(jié)構(gòu)域由七個α螺旋組成,其中六個螺旋在ARID家族中保守。此外化學(xué)位移擾動實驗表面了SWI1ARID結(jié)構(gòu)域具有DNA結(jié)合活性。釀酒酵母SWI1ARID結(jié)構(gòu)域與人SWI1ARID結(jié)構(gòu)域類似,可以非特異地結(jié)合DNA。對SWI1ARID結(jié)構(gòu)域
4、溶液結(jié)構(gòu)的解析和其非特異性結(jié)合DNA性質(zhì)的探討,使我們更深入地了解了ARID結(jié)構(gòu)域家族的結(jié)構(gòu)及其DNA結(jié)合特性,也為進(jìn)一步解釋酵母染色體重塑復(fù)合物SWI/SNF在基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控方面的功能提供了幫助。
3.SUV39H1是在人類中發(fā)現(xiàn)的第一個組蛋白賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶,它參與染色質(zhì)的修飾和基因轉(zhuǎn)錄過程。SUV39H1在N端有一個chromodomain,該結(jié)構(gòu)域參與甲基化賴氨酸的識別和SUV39H1在染色體上的定位。我們解析了人類
5、SUV39H1chromodomain的晶體結(jié)構(gòu)。SUV39H1chromodomain的結(jié)構(gòu)與其它chromodomain相比,總體上是保守的。但不同的是,SUV39H1chromodomain在C端有一段較長的螺旋。此外,通過表面等離子共振實驗我們發(fā)現(xiàn)該結(jié)構(gòu)域可以特異性地識別H3K9me3。SUV39H1chromodomain結(jié)構(gòu)的解析,尤其是關(guān)于其對H3K9me3特異性識別的研究將有助于我們進(jìn)一步了解SUV39H1蛋白在組蛋白的
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