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文檔簡介
1、研究背景:
胰腺癌是常見的消化系統(tǒng)惡性腫瘤之一,在我國胰腺癌的發(fā)病率逐年上升,目前已躍居全身腫瘤第6位??傮w上講,胰腺癌病因復雜,發(fā)生發(fā)展中具有異質(zhì)性。胰腺導管腺癌是最常見的胰腺癌類型,根治性手術(shù)對于可切除性腫瘤患者仍是唯一可以獲得長期生存的治療方法。然而,胰腺癌早期診斷困難,易侵襲,對各種治療缺乏敏感性,預后較差,死亡率幾乎等同于發(fā)病率。過去的25年間,胰腺癌總體預后并無明顯改善,5年生存率小于5%,中位生存時間約5~6個月
2、。胰腺癌的發(fā)病形勢日益嚴峻,病死率一直居高不下,目前對胰腺癌的生物學標志進行了大量而廣泛的研究,包括基因標記、血清學標記和細胞學標記等,由于這些指標的特異性和敏感性各有差異,利用這些免疫標志物進行診斷仍有很多缺陷,需要有對胰腺癌的診治有臨床意義更好的指標。目前胰腺癌的基因診治是研究熱點之一。microRNAs(miRNAs)是由20-25個核苷酸所組成的小分子單鏈RNA,可通過堿基互補配對結(jié)合靶基因的3’非編碼區(qū)(UTR),影響mRNA
3、翻譯和蛋白合成。miRNAs屬基因負調(diào)控因子??稍谵D(zhuǎn)錄后水平調(diào)控靶基因的表達,從而影響細胞的發(fā)育、分化和凋亡等,近年來研究發(fā)現(xiàn),胰腺癌組織、細胞株、癌前病變、和血漿中均存在miRNAs表達譜異常,提示miRNAs可能在胰腺癌發(fā)生和發(fā)展機制的研究、診斷、治療和預后判斷中具有一定應用價值。
研究目的
本研究旨在檢測miR-216a在胰腺癌組織與非胰腺癌組織中的表達,篩選并驗證miR-216a與細胞增殖有關(guān)的靶基因JAK2
4、,合理聯(lián)系miR-216a與JAK/STAT通路。
研究方法
1.20例胰腺癌組織與非胰腺癌組織中總RNA的提取。采用agilent人microRNA寡核苷酸基因芯片在基因組范圍內(nèi)檢測組織標本的microRNA基因表達譜,差異基因的篩選標準是microRNA相對表達量大于或等于對照組2倍。
2.應用TargetScanHuman5.1、microrna.org、mirbaseandPicTaralgorit
5、hms預測并篩選miR-216a與細胞增殖有關(guān)的靶基因。
3.JAK23’UTR與mutJAK23’UTR測序,預測結(jié)合位點,擴增,PCR釣取基因,目段片段(JAK23’UTR或mutJAK23’UTR)與載體(PsiCHECK-2)連接,miR-216amimics與miR-216ainhibitor(miR-216a反義鏈)合成。NC(negativecontrol;隨機合成的一條堿基鏈)及NCinhibitor(NC的反
6、義鏈)的合成。
4.PANC-1細胞培養(yǎng),microRNA與質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染細胞,Lucifersae檢測。
5.miR-216amimics與miR-216ainhibitor轉(zhuǎn)染PANC-1細胞,WesternBlot檢測JAK2蛋白表達。
6.采用SPSS13.0軟件分析,miR-216a的表達量以log2轉(zhuǎn)換樣本歸一化(normalization)后的芯片掃描信號值為記。胰腺癌組與良性病變組miR-216
7、a的表達差異采用獨立樣本T檢驗,計量資料均數(shù)間的比較采用單因素方差分析,以雙側(cè)檢驗P<0.05為有統(tǒng)計學意義。
研究結(jié)果
1.20例胰腺標本的RNA濃度測定:所有樣品A260/A280在1.8~2.0之間,RNA純度較高,無DNA、蛋白質(zhì)等污染。
2.miR-216a的表達量測定:miR-216a在胰腺癌組織中的表達明顯低于非胰腺癌組織,差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.000)。
3.JAK2的3’U
8、TR大小為1392bp,用模板DNA擴增后在MarkerDL2000的1kb上方可見有一條比較特異條帶。PsiCHECK-2約7kb,目的片段與質(zhì)粒連接后質(zhì)粒酶切鑒定陽性克隆,在1kb左右(基因片段)與6kb左右(載體片段)分別切出一條相應帶。并且,連接后測序,測序結(jié)果與NCBI公布的JAK23’UTR、mutJAK23’UTR序列進行Blast分析,提示目的片段已成功克隆入雙螢光報告載體psiCHECK-2中,可以用于后續(xù)雙螢光檢測;
9、
4.JAK2是miR-216a與細胞增殖的靶基因之一。在轉(zhuǎn)染克隆有JAK23’UTR質(zhì)粒的實驗中,mir-216a組與空白組相比差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.000),mir-216a組與NC組相比差異具有統(tǒng)計學意義(P=0.000),證明miR-216a能與JAK23’UTR結(jié)合,從而抑制螢光素酶的活性。在轉(zhuǎn)染克隆有mutJAK2-4基因3’UTR質(zhì)粒的實驗中,mir-216a組與空白組和NC組相比差異無統(tǒng)計學意義(P=0.
10、280;P=0.329),證明miR-216a不能與mutJAK23’UTR結(jié)合,從而抑制螢光素酶的活性。在轉(zhuǎn)染Psi-CHECK2質(zhì)粒的實驗中,mir-216a組與空白組和NC組相比差異無統(tǒng)計學意義(P=0.848;P=0.258),證明Psi-CHECK2上沒有miR-216a的結(jié)合位點,miR-216a具有靶向性結(jié)合。
5.胰腺癌細胞系PANC-1細胞培養(yǎng),生長良好,形態(tài)正常,無污染。PANC-1細胞中JAK2蛋白表達量
11、升高。轉(zhuǎn)染72小時后miR-216amimics組與miR-216ainhibitor組中JAK2蛋白表達顯著差異(miR-216ainhibitor組JAK2蛋白相對灰度值分別為空白對照組及mimics組的1.333倍和68.038倍)。JAK2蛋白表達量與miR-216a水平呈負相關(guān)。
研究結(jié)論
1.miR-216a在胰腺癌組織與非胰腺癌組織的表達具有顯著差異,miR-216a在胰腺癌組織中表達顯著下調(diào)。
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