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1、對(duì)DPV UL10基因(GenBank登錄號(hào)EU195100)進(jìn)行了分子特性分析,利用RT-PCR對(duì)DPV UL10基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄時(shí)相分析,結(jié)果如下:
1.鴨瘟病毒UL10基因的分子特性分析DPV UL10基因全長(zhǎng)1230bp,由409個(gè)氨基酸殘基組成,等電點(diǎn)為9.05; UL10蛋白含有1個(gè)信號(hào)肽和8個(gè)跨膜區(qū),主要定位于細(xì)胞質(zhì)中。UL10蛋白含有15個(gè)潛在的磷酸化位點(diǎn)。序列對(duì)比分析表明DPV CHvUL10與與α皰疹病毒的
2、核苷酸同源性較高,其核苷酸序列與Gallid herpesvirus2、Psittacidherpesvirusl、Human herpesvirus5和Meleagrid herpesvirus1的同源性為54.5%,3.5%,41.5%和46.4%,表明它們可能功能相似。
2.鴨瘟病毒UL10基因序列的密碼子偏愛(ài)性分析DPV CHv株UL10基因在其它相關(guān)23株皰疹病毒之間高度保守,與α皰疹病毒的核苷酸同源性較高。相關(guān)
3、數(shù)據(jù)顯示DPV UL10同義密碼子的使用呈偏愛(ài)性。DPV UL10基因與大腸桿菌、酵母及人密碼子使用頻率差值分別有27個(gè),酵母有21個(gè),人有29個(gè)。相關(guān)性分析顯示DPV UL10基因密碼子與酵母之間存在較顯著關(guān)系(P<0.05)。
3.鴨瘟病毒UL10基因的轉(zhuǎn)錄時(shí)相:根據(jù)DPV UL10基因和內(nèi)參基因β-actin的保守序列分別設(shè)計(jì)了熒光定量引物,收集感染鴨瘟病毒后0.5h、1h、2h、4h、8h、12h、24h、36h、
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