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文檔簡介
1、帶你走進神秘的長鏈非編碼帶你走進神秘的長鏈非編碼RNA長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默,基因組印記以及染色質修飾,轉錄激活,轉錄干擾,核
2、內運輸等多種重要的調控過程,lncRNA的這些調控作用也開始引起人們廣泛的關注。哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產生的轉錄本是lncRNA(相應的蛋白編碼RNA的比例是1%),雖然近年來關于lncRNA的研究進展迅猛,但是絕大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的。生物學功能許多l(xiāng)ncRNA都具有保守的二級結構,剪切形式以及亞細胞定位,這種保守性和特異性表明它們是具有功能的。但lncRNA的功能相對于micrNA和蛋白質的功能來說更
3、加難以確定,因為目前并不能僅根據序列或者結構來推測它們的功能。根據它們在基因組上相對于蛋白編碼基因的位置,可以將其分為(1)sense(2)antisense(3)bidirectional(4)intronic(5)intergenic這5種類型。這種位置關系對于推測lncRNA的功能有很大幫助。白編碼基因的轉錄本形成互補雙鏈(紫),進一步在Dicer酶作用下產生內源性的siRNA,調控基因的表達水平。5)通過結合到特定蛋白質上,ln
4、cRNA轉錄本(綠)能夠調節(jié)相應蛋白的活性。6)作為結構組分與蛋白質形成核酸蛋白質復合體。7)通過結合到特定蛋白上,改變該蛋白的胞質定位。8)作為小分子RNA,如miRNA,piRNA的前體分子轉錄(JeremyE.Wiluszetal2009GenesDev.)。一般來說,lncRNA主要從以下三種層面實現(xiàn)對基因表達的調控:1.表觀遺傳學調控lncRNA招募染色質重構復合體到特定位點進而介導相關基因的表達沉默。例如來源于HOXC基因座
5、的lncRNAHOTAIR,它能夠招募染色質重構復合體PRC2并將其定位到HOXD位點,進而誘導HOXD位點的表觀遺傳學沉默。同樣,Xist,Air,Kcnq1ot1這些lncRNA都能夠通過招募相應的重構復合體,利用其中的甲基轉移酶如Ezh2或者G9a等實現(xiàn)表觀遺傳學沉默。2.轉錄調控lncRNA能夠通過多種機制在轉錄水平實現(xiàn)對基因表達的沉默,表現(xiàn)在如下幾個方面:lncRNA的轉錄能夠干擾臨近基因的表達。例如在酵母中,SER3基因會受
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