毛囊組織dna提取方法的研究_第1頁
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文檔簡介

1、藥物性耳聾線粒體12SrRNA基因1555G點突變基因檢測的實驗室技術(shù)體系1人頭發(fā)毛囊組織人頭發(fā)毛囊組織DNA提取方法的研究提取方法的研究技術(shù)保障與研發(fā)部魏宏泉摘要摘要本研究以人頭發(fā)的毛囊組織為材料,在動物組織總DNA提取的經(jīng)典技術(shù)方案基礎(chǔ)上,兼顧效率、成本和產(chǎn)率等三方面因素,對毛囊組織DNA提取方法進(jìn)行了優(yōu)化,并設(shè)計了實用有效的取樣方法。研究結(jié)果顯示,可以以少至一根帶毛囊的頭發(fā)為材料,在40分鐘時間內(nèi)獲得約0.5?g組織DNA,其產(chǎn)量

2、和質(zhì)量可以滿足基因檢測工作后續(xù)流程的需要。同時,一次提取過程所耗藥品試劑的成本約為0.3元,大大低于以微量血為材料的試劑盒提取法的成本。在以RFLP法對線粒體12srRNA基因1555位點進(jìn)行基因檢測的技術(shù)體系中,組織DNA提取是實驗室工作的第一步,該工作的效率、質(zhì)量、成本等因素對整體檢測流程具有至關(guān)重要的影響。在此之前的研究工作中,我們確定了以微量血為材料提取組織DNA的技術(shù)方法,但為了使基因檢測項目的實施具有更強(qiáng)的可操作性,設(shè)計多樣

3、化的組織樣本采集形式則是必需的。為此,本研究以人頭發(fā)毛囊組織為材料,旨在建立適用的取樣方法和DNA提取方法的技術(shù)體系。1.材料與方法材料與方法人頭發(fā)毛囊組織人頭發(fā)毛囊組織取自健康成年人。取樣方法:用鑷子夾住頭發(fā)根部的部位,順著毛發(fā)生長方向用力一拔即可,此時在毛發(fā)根部應(yīng)明顯可見白色或半透明的毛囊組織。然后用剪刀剪去大部分的毛干部分,將毛根帶有毛囊組織的部分置于1.5mlEppendf管內(nèi)。試劑配制試劑配制(1)ProteinaseKPro

4、teinaseK用去離子水溶解,濃度20mgml。(2)組織消化液10mMTrisHCl,pH7.510mMEDTA10mMNaCl0.5%SDS(3)LiCl溶液無水LiCl用去離子水溶解,濃度為7.5M。(4)TE溶液10mMTrisHCl,pH7.50.1mMEDTA,pH8.0參考操作程序參考操作程序(1)加入60?l消化液,再加入1?l蛋白酶K溶液,用渦旋混合器震蕩5秒鐘。藥物性耳聾線粒體12SrRNA基因1555G點突變基因

5、檢測的實驗室技術(shù)體系32.結(jié)果與分析結(jié)果與分析2.1頭發(fā)數(shù)量對頭發(fā)數(shù)量對DNA提取結(jié)果的影響提取結(jié)果的影響以16根頭發(fā)為材料,每組都可以有效提取出基因組DNA,13根頭發(fā)組的DNA產(chǎn)量有較為明顯的隨頭發(fā)數(shù)增多而產(chǎn)量也增多的變化,36根頭發(fā)組的DNA產(chǎn)量則沒有明顯差別。如圖1所示。在圖1顯示的電泳結(jié)果中,第1、2、3條帶的亮度逐漸增加,說明隨著頭發(fā)數(shù)的增加其相應(yīng)的DNA產(chǎn)量也隨之增加,而第3、4、5、6條帶的亮度差異不明顯,說明所獲得的D

6、NA產(chǎn)量基本相同注1。而事實上16根頭發(fā)中所含DNA的量應(yīng)該是隨頭發(fā)數(shù)量增加而遞增的,出現(xiàn)這種矛盾現(xiàn)象的可能原因是:相同的消化液和蛋白酶K使用量并不適用于處理不同數(shù)量頭發(fā)。在本實驗中,所使用的60?l消化液和1?l蛋白酶K可能是對應(yīng)于13根頭發(fā)的合適用量,可以達(dá)到完全裂解細(xì)胞膜和細(xì)胞核并釋放DNA的效果,而46根頭發(fā)可能造成了蛋白酶反應(yīng)底物的過量,這些過量的組織細(xì)胞并沒有被裂解,因此所釋放出的總DNA量仍與13根頭發(fā)釋放的DNA量相當(dāng)。

7、從電泳結(jié)果顯示的條帶亮度來看,由于所使用的DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)每條帶的亮度約為20ng,因此可以估測認(rèn)為,本實驗從一根頭發(fā)中提取出的基因組DNA約為400600ng,該產(chǎn)量對于基因檢測的技術(shù)實施來說已經(jīng)足夠,完全可以滿足后續(xù)工作的需要。2.2蛋白酶蛋白酶K消化對消化對DNA提取結(jié)果的影響提取結(jié)果的影響在蛋白酶K反應(yīng)體系中,組織樣本中細(xì)胞的裂解率是受酶促反應(yīng)時間和酶與底物比例影響的。本實驗中各組均以一根頭發(fā)為材料提取DNA,同時所使用的蛋白酶

8、K適度過量,結(jié)果DNA產(chǎn)量出現(xiàn)了隨時間而變化的梯度上升。(1)蛋白酶)蛋白酶K消化時間對消化時間對DNA提取結(jié)果的影響。提取結(jié)果的影響。注1:DNA條帶的亮度差異包含因不同樣本的毛囊大小不同而導(dǎo)致的DNA產(chǎn)量差異這一因素,本研究中對此差異忽略不計。本研究中各實驗都存在此現(xiàn)象,在此一并說明,后文不再一一注解。Lane1:一根頭發(fā)提取DNA的結(jié)果Lane2:二根頭發(fā)提取DNA的結(jié)果Lane3:三根頭發(fā)提取DNA的結(jié)果Lane4:四根頭發(fā)提取

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