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文檔簡介
1、華中科技大學博士學位論文NKX2.5新突變的鑒定、功能分析及其無義突變的通讀研究姓名:歐陽平申請學位級別:博士專業(yè):遺傳學指導教師:王擎;凃欣2011-04-18II華 中 科 技 大 學 博 士 學 位 論 文 掃描分析, 目的在于尋找漢族散發(fā)先天性心臟病樣本中 NKX2.5 的突變情況。 我們發(fā)現(xiàn)單核苷酸多態(tài) rs2277923(Single nucleotide polymorphism,SNP)在病人中具有
2、較高的頻率, 與 105 例對照樣本相比, 小等位基因 A 的頻率顯著 (P=0.04) , 顯示 NKX2.5 SNP rs2277923 可能與漢族先天性心臟病的發(fā)生相關,還需要加大樣本分析。功能研究表明SNP rs2277923(63a>g)編碼的蛋白定位于細胞核,和野生型相比約降低 20%的轉錄活性。 在第 3 部分的研究中,我們對 8 個已經報道的 NKX2.5 無義突變進行結構和功能分析和氨基糖苷類抗生素誘導無義突
3、變的通讀實驗。首先構建 NKX2.5 無義突變在pcDNA3.1 載體上的表達質粒 (pE109X, pQ149X, pQ170X, pQ187X, pQ198X, pY256X,pY259X 和 pC264X)和 3 個突變(E109X,Q149X 和 C264X)在 pEGFP- N1 上的融合蛋白表達質粒 NKX2.5mut- EGFP。在 HeLa 細胞中對 NKX2.5 的 8 個突變進行免疫熒光定位分析和雙報告熒光素酶系統(tǒng)的
4、轉錄活性檢測。 結果表明 pQ198X, pY256X, pY259X能使 ANFp- Luc 的轉錄活性增加約 2 倍, pC264X 和 pWT- NKX2.5 能使 ANFp- Luc 的轉錄活性增加 4- 5 倍,而 pE109X,pQ149X,pQ170X,pQ187X 完全沒有轉錄活性。pWT- NKX2.5, pQ198X, pY256X, pY259X和pC264X定位于細胞核, 而pE109X, pQ149X,pQ17
5、0X,pQ187X 的定位發(fā)生改變。接下來進行通讀的定性試驗,在 HeLa 細胞中轉染突變的 NKX2.5- EGFP 分別加入氨基糖苷類抗生素慶大霉素(gentamicin)和 G418,孵育 48- 72 h,熒光顯微鏡下觀察 EGFP 的強度,判斷無義突變是否有通讀以及藥物的工作濃度。然后,選擇合適的藥物濃度對 8 個無義突變質粒誘導通讀,并通過檢測誘導后轉錄活性的變化來估算通讀效率。結構- 功能的結果表明 NKX2.5 蛋白的
6、 C 端對于其轉錄活性很重要; HD 區(qū)域內的一段 R/K 富集的序列 (Q187NRRYKCKRQR197) 對于 NKX2.5蛋白的正確定位是必須的。 通讀實驗結果表明 gentamicin 和 G418 均能誘導 8 個 NKX2.5無義突變通讀,并且通讀效率最高可達到 13.8%和 32.2%。該結果為攜帶 NKX2.5 無義突變的先天性心臟病病人的基因治療提供了潛在的可能性。 關鍵詞: 關鍵詞:先天性心臟病 房間隔缺損 NKX
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