遺傳性非綜合征型耳聾兩種致病基因易感位點的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、遺傳性耳聾是最常見的遺傳病之一，平均每1000個新生兒中就有1個先天性耳聾患者。我國每年新生聾兒中約有50％是由遺傳因素造成的。 耳聾發(fā)病具有高度的遺傳異質(zhì)性，目前已發(fā)現(xiàn)100多種致聾基因。國內(nèi)非綜合征型耳聾患者中，由DFNBl和SLC26A4基因發(fā)生突變而致聾的患者占了50％以上。目前國內(nèi)外對DFNBl和SLC26A4進(jìn)行了大量的研究，已肯定其在耳聾致病中起著非常重要的作用。但迄今為止，有關(guān)DFNBl和SLC26A4基因單核苷

2、酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism，SNP)及單體型(haplotype)與耳聾的遺傳關(guān)聯(lián)性的研究，國內(nèi)外仍未見相關(guān)報道。 因此，本研究擬通過關(guān)聯(lián)分析的方法來探討遺傳性非綜合征型耳聾兩種類型致病基因易感位點DFNBl和SLC26A4的SNPs，以及所構(gòu)建的單體型，在散發(fā)性耳聾患者和正常個體間是否存在差異，從而為臨床遺傳性耳聾的診斷和產(chǎn)前篩查提供重要的方法和證據(jù)。 我們選取了DFNBl的

3、rs2274084(C/T)，rs2274083(C/T)，rs7322538(A/G)，rs9315400(C/T), snp-235delC(C/-)五個SNPs，SLC26A4的rs2248465(C/T)，rs2395911(C/T)，rs2712218(C/T)，rs982663(A/G)四個SNPs，采用等位基因特異性PCR(allele specific realtime PCR)和DNA序列測定的方法對以上9個SNPs進(jìn)

4、行基因分型，統(tǒng)計分型結(jié)果，驗證哈迪.溫伯格平衡(Hardy-weinberg equilibrium，HWE)，用SHEsis軟件進(jìn)行等位基因頻率(allele frequencies)、基因型頻率(genotype frequencies)和單體型(haplotype)的統(tǒng)計分析。研究結(jié)果顯示，DFNB1位點的rs2274084，rs2274083，snp-235delC和SLC26A4的rs982663在散發(fā)性耳聾患者和正常對照間存

5、在顯著的差異。進(jìn)一步驗證了DFNB1和SLC26A4在耳聾發(fā)病中的重要作用。其中DFNBl的rs2274084，rs2274083，SLC26A4的rs2395911，rs2712218和rs982663存在顯著的相關(guān)性(D’>0.7)，根據(jù)其相關(guān)性構(gòu)建的單體型C-C和T-T，G-A-C和G-G-C在耳聾患者和正常對照中具有顯著差異性，C-C，G-A-C單體型在耳聾患者組顯著高于正常對照組，而T-T，G-G-C單體型在患者組則明顯低于正