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文檔簡介
1、背景:
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是一種好發(fā)于東南亞地區(qū)及我國南方各省的常見惡性腫瘤[1]。鼻咽癌患者放療后局部的復(fù)發(fā)以及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是制約其療效和預(yù)后的瓶頸,放射抗拒是制約鼻咽癌患者5年生存率的關(guān)鍵因素[2,3]。有研究表明,輻射誘導(dǎo)的基因調(diào)控和表達(dá)的差異可能與放射抗拒的發(fā)生有關(guān)[4-7]。因此,尋找能夠早期預(yù)測鼻咽癌輻射敏感性的分子標(biāo)志物對于個體化放射治療具有重要意義。
本課題
2、組將前期篩選出與放射抗拒相關(guān)的分子標(biāo)志物進(jìn)行基因本體論(gene ontology)、通路分析(Pathway analysis)及蛋白質(zhì)互做網(wǎng)絡(luò)技術(shù)(Protein interaction network)進(jìn)行綜合分析,從放射抗拒相關(guān)基因或蛋白質(zhì)互做網(wǎng)絡(luò)中獲取多個與輻射抗拒相關(guān)的關(guān)鍵性標(biāo)志物。
我們選取在通路構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)上的節(jié)點(diǎn)之一的c-jun作為候選基因,為明確c-jun基因與鼻咽癌放射抗拒之間的相關(guān)性,我們利用RNA干擾技術(shù)
3、抑制放射抗拒人鼻咽癌細(xì)胞系CNE-2R中高表達(dá)的c-jun基因,探究其對CNE-2R細(xì)胞放射敏感性的影響及其潛在機(jī)制。初步探討c-jun基因能否成為鼻咽癌分子治療的新靶點(diǎn)。
研究內(nèi)容
第一部分 慢病毒shRNA載體構(gòu)建并建立穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的CNE-2R細(xì)胞株
目的:
本課題組前期發(fā)現(xiàn)c-jun基因在放射抗拒細(xì)胞株CNE-2R中呈高表達(dá),因其涉及多條通路且是基因互作網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)之一,為明確c-jun基
4、因與鼻咽癌放射抗拒之間的相關(guān)性,我們利用RNAi抑制放射抗拒人鼻咽癌細(xì)胞系CNE-2R中高表達(dá)的c-jun基因,并篩選穩(wěn)定表達(dá)的細(xì)胞株,為探究其對CNE-2R細(xì)胞放射敏感性的影響奠定基礎(chǔ)。
方法:
1.采用RT-PCR及Western blot實(shí)驗(yàn)分別在mRNA及蛋白水平上驗(yàn)證c-jun基因的表達(dá)。
2.設(shè)計(jì)合成3組特異性針對c-jun基因的siRNA,構(gòu)建慢病毒shRNA載體,感染CNE-2R細(xì)胞。
5、> 3.將感染目的細(xì)胞CNE-2R,經(jīng)流式分選獲得穩(wěn)定的細(xì)胞株,采用RT-PCR和Western blot實(shí)驗(yàn)檢測各組對目的基因的抑制效果,篩選出沉默效果最佳的靶點(diǎn)。
結(jié)果:
1.RT-PCR和Western blot實(shí)驗(yàn)檢測c-jun基因的表達(dá)情況與芯片結(jié)果相符。
2.經(jīng)測序證實(shí),3組特異性針對c-jun基因的siRNA,成功構(gòu)建慢病毒shRNA載體,并包裝出滴度為8×108TU/ml。感染CNE-2R
6、細(xì)胞,熒光倒置顯微鏡下觀察,顯示各組感染效率均在80%以上,感染成功。
3.RT-PCR和Western blot篩選出最佳干擾靶點(diǎn),siRNA序列為:CA AACCTCAGCAACTTCAA。
結(jié)論:
RNA干擾技術(shù)可有效抑制放射抗拒人鼻咽癌細(xì)胞系CNE-2R中高表達(dá)的c-jun基因,為后續(xù)實(shí)驗(yàn)奠定基礎(chǔ)。
第二部分 慢病毒介導(dǎo)的C-jun基因沉默對放射抗拒人
鼻咽癌CNE-2R細(xì)胞生物
7、學(xué)行為及放射敏感性的影響
目的:利用RNA干擾技術(shù)抑制放射抗拒人鼻咽癌細(xì)胞系CNE-2R中高表達(dá)的c-jun基因,觀察c-jun基因沉默后對CNE-2R細(xì)胞的存活能力、周期、凋亡及放射敏感性的影響,了解c-jun基因與鼻咽癌放射敏感性間的相關(guān)性。
方法:
1.CCK-8實(shí)驗(yàn)檢測感染前后細(xì)胞的生長情況,分析c-jun基因沉默前后對CNE-2R細(xì)胞生存率的影響。
2.克隆形成實(shí)驗(yàn)測定c-jun基因沉默
8、前后,CNE-2R細(xì)胞放射敏感性的變化。
3.流式細(xì)胞術(shù)檢測經(jīng)0 Gy和2 Gy處理后各組細(xì)胞周期及凋亡率的變化,分析c-jun基因沉默后對CNE-2R細(xì)胞周期及凋亡的影響。
結(jié)果:
1.CCK-8實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:6MVX射線聯(lián)合c-jun基因沉默組在0、2、4、6和8 Gy照射后細(xì)胞的吸光度OD值均顯著低于未轉(zhuǎn)染組和陰性對照組(F=42.70~200.67,P<0.05)。
2.克隆形成實(shí)驗(yàn)顯示,
9、c-jun基因沉默組與未轉(zhuǎn)染組及陰性對照組相比,SF2、D0和Dq值均減小,放射增敏比(SERD0)為1.41。
3.細(xì)胞周期結(jié)果顯示:0Gy:未轉(zhuǎn)染組、NC組和c-jun-RNAi-LV2實(shí)驗(yàn)組G2/M所占比例分別為18.27±5.28,17.13±3.35,27.33±1.58,c-jun基因沉默組與另兩組相比G2/M所占比例增加(P<0.05);2Gy:三組G2/M所占比例分別為19.93±4.99,17.63±3.01
10、,28.57±2.9(P<0.05)。
4.細(xì)胞凋亡實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,未經(jīng)照射的c-jun基因沉默組與聯(lián)合2 Gy照射的凋亡率分別為(20.93±1.99)%和(38.17±0.83)%,均高于未轉(zhuǎn)染組和陰性對照組的凋亡率[0 Gy:(10.97±0.70)%和(10.80±1.25)%;2 Gy:(20.43±0.25)%和(19.53±1.50)%;F=50.54、330.14,P<0.05]。
結(jié)論:
c
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