新型突變mucA基因編碼蛋白的亞細胞定位、對生物被膜形成的影響及其機制的探討.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:探討新型突變mucA56基因編碼蛋白的亞細胞定位,并觀察mucA56基因對生物被膜形成的影響,探討mucA56基因影響生物被膜形成的機制。
   方法:采用含NcoI和XbaI 酶切位點的引物,從Pmd18t-HR擴增mucA56基因的全長克隆到Pmf54構建Pcaq56,XbaI單酶切Ppho7載體中的堿性磷酸酶基因全長插入到Pcaq56的開放閱讀框中,構建mucA56-phoA融合表達載體Pcaq57。對構建的Pcaq

2、57載體進行PCR鑒定及序列測定,并使用堿性磷酸酶抗體驗證融合蛋白的表達。將Pcaq57、Pkmg170(陰性對照質粒)、Pkmg176(陽性對照質粒)分別轉化大腸桿菌和銅綠假單胞菌,劃線接種在含有堿性磷酸酶作用底物BCIP的LB瓊脂平板上,觀察各自菌落顏色以評估堿性磷酸酶活性;從pGFPuv質粒中擴增表達增強型綠色熒光蛋白的基因全長,克隆入大腸桿菌-銅綠假單胞菌穿梭質粒(Pucp20),構建一個穩(wěn)定的銅綠假單胞菌綠色熒光蛋白表達載體(

3、Pucp20/GFPuv),采用電轉化的方式將Pucp20/GFPuv導入到銅綠假單胞菌PAO1、PDO300(含經典突變mucA22基因的粘液型PAO1同源菌株)、PAOmucA56(含新型突變mucA56基因的粘液型PAO1同源菌株)中,采用改良的流動介質體外培養(yǎng)生物被膜,應用激光共聚焦顯微鏡觀察生物被膜形成第1、3、5天的形態(tài)和結構;收集三者生物被膜形成第一、三、五天的生物被膜細菌,提取細菌全蛋白進行蛋白質二維電泳,找出PAO1、

4、PAOmucA56表達水平相同而與PDO300表達水平差異的蛋白點,采用基質輔助的激光解吸/電離飛行時間(MALDI-TOF MS)分析差異蛋白質。
   結果:對構建的融合表達載體Pcaq57進行PCR鑒定及序列測定,結果表明phoA基因正向插入到mucA56的開放閱碼框中;Western Blot進一步證實了融合蛋白的表達;以上提示成功構建了mucA56-phoA融合蛋白表達載體Pcaq57。轉化了Pcaq57的大腸桿菌和銅

5、綠假單胞菌,以及轉化了Pkmg170的大腸桿菌和銅綠假單胞菌,在含有堿性磷酸酶作用底物BCIP的LB瓊脂平板上,均表現為白色菌落,提示為無活性的堿性磷酸酶活動。而轉化了Pkmg176的大腸桿菌和銅綠假單胞菌,在含有堿性磷酸酶作用底物BCIP的LB瓊脂平板上均表現為藍色菌落,提示為有活性的堿性磷酸酶活動;激光共聚焦顯微鏡觀察PAOmucA56、PAO1、PDO300第1、3、5天生物被膜形態(tài),結果顯示:PAOmucA56、PAO1的形成方

6、式為水平鋪散,其成熟生物被膜形態(tài)為均一的薄膜狀,基質覆蓋完全,PAOmucA56成熟生物被膜平均厚度約為30mm,PAO1成熟生物被膜平均厚度約為25mm;PDO300的形成方式為局部堆積,呈山丘狀,成熟生物被膜具有很大的異質性,以低的基質覆蓋和大的微生物菌落間隔為特點,生物被膜最高厚度約為36mm。生物被膜形成第一天、第三天、第五天的生物被膜細菌全蛋白二維電泳,PAO1和PAOmucA56表達相同而與PDO300差異表達的蛋白點分別有

7、8個、6個、15個。29個蛋白的質譜分析結果表明,有12個蛋白的質譜分析結果可信度不高(MS﹤66)。篩選出來的17個候選蛋白中,DNA指導的RNA聚合酶b亞單位、谷氨酰胺合成酶、延長因子Tu、DNA指導的RNA聚合酶a亞單位、內肽酶Clp2、延長因子G1、熱休克蛋白 HtpG、ATP依賴的Clp蛋白ATP結合亞單位 clpX、觸發(fā)因子在PDO300中相對低表達,而30S核糖體蛋白S18、磷酸烯醇丙酮酸羧激酶、丙酮酸脫氫酶復合物二氫硫辛

8、酰賴氨酸基乙酰轉移酶、PasP、生物素羧化酶、精氨酸脫亞氨酸、鳥氨酸氨甲酰轉移酶、絲氨酸羥甲基轉移酶3在PDO300中相對高表達;其中clp蛋白酶家族(內肽酶Clp2和ATP依賴的Clp蛋白ATP結合亞單位 clpX)分別在第三天、第五天生物被膜細菌中有PDO300的相對低表達。
   結論:mucA56基因編碼的產物定位在細胞質;藻酸鹽可以影響生物被膜結構,而mucA56基因存在藻酸鹽以外的途徑影響生物被膜的形成;mucA56

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