人臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞培養(yǎng)液上清對(duì)肝癌細(xì)胞系HepG2影響的比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究.pdf

1、間充質(zhì)干細(xì)胞(Mesenchymal stem cells，MSCs)是一類(lèi)來(lái)源于中胚層的成體干細(xì)胞，因其具有低免疫源性和來(lái)源廣泛的特點(diǎn)，被廣泛應(yīng)用于各種疾病的，如心血管疾病、神經(jīng)疾病、免疫缺陷疾病及癌癥等。大量研究證明，MSCs可歸巢至腫瘤，并對(duì)腫瘤的微環(huán)境起至關(guān)重要的作用。其分泌的細(xì)胞因子、生長(zhǎng)因子等，對(duì)腫瘤細(xì)胞的增殖、擴(kuò)散及腫瘤內(nèi)血管形成等均有不同程度的影響。實(shí)驗(yàn)室前期研究表明，UC-MSCs培養(yǎng)液上清對(duì)肝癌細(xì)胞系HepG2的增殖

2、具有抑制作用。
　　本研究對(duì)5個(gè)不同時(shí)間段UC-MSCs上清培養(yǎng)液處理的HepG2細(xì)胞進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（包括對(duì)照），分別獲得了約4767，4768，4774，4769和4753萬(wàn)條reads，搭建了HepG2細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組信息平臺(tái)。所得數(shù)據(jù)與基因組比對(duì)發(fā)現(xiàn)，每個(gè)樣本的基因組覆蓋率和基因覆蓋率分別可達(dá)到84％和78％以上，表達(dá)基因條數(shù)1.6萬(wàn)余條，可變剪接事件大于5萬(wàn)個(gè)，識(shí)別出5萬(wàn)多個(gè)SNP位點(diǎn)，基因融合事件約20個(gè)。兩兩比對(duì)差異表達(dá)

3、基因(DEGs)數(shù)目表明，隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng)，DEGs數(shù)目不斷增加。對(duì)DEGs分別進(jìn)行了GO注釋和KEGG注釋?zhuān)玫搅舜罅孔⑨屝畔?其中，在處理至24h后，共有117條DEGs在細(xì)胞增殖條目中，共59條DEGs聚類(lèi)在增殖相關(guān)通路MAPK通路中，69條DEGs聚類(lèi)在癌癥相關(guān)通路中等。結(jié)合了他們的表達(dá)模式，對(duì)它們?cè)赨C-MSCs上清抑制HepG2細(xì)胞增殖現(xiàn)象中發(fā)揮的作用進(jìn)行了討論。通過(guò)qRT-PCR手段對(duì)部分DEGs進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，基因表達(dá)