從轉錄水平研究NIH3T3細胞周期進程中基因表達的差異與功能.pdf

1、為從轉錄水平研究永生化的小鼠成纖維細胞NIH3T3細胞周期進程中的基因表達差異與功能，本文通過血清饑餓法建立NIH3T3細胞周期模型，用Mouse Genome4302.0芯片檢測細胞周期過程中相關基因的表達豐度，用IPA軟件、QIAGEN和KEGGPATHWAY等網(wǎng)站資料分析基因表達變化預示的信號通路對細胞周期進程的調(diào)節(jié)作用，并以c-FOS和NKX2-5為切入點，對NIH3T3細胞進行慢病毒轉染，初步探究二者對小鼠成纖維細胞周期的調(diào)控

2、作用影響。芯片數(shù)據(jù)分析表明，2349個基因的ratio值大于對照3倍，為上調(diào)基因。2255個基因的ratio值小于對照3倍，為下調(diào)基因。55個基因表達上下調(diào)。上述基因共計4659個，統(tǒng)稱為有意義表達變化基因。GO注釋分類表明，這些有意義表達變化的基因涉及細胞增殖和細胞周期等33種生理活動。在這些有意義表達變化基因中，有891個基因為細胞周期相關基因，其中的548個基因表達上調(diào)，336個基因表達下調(diào)，7個基因表現(xiàn)上下調(diào)。114個細胞周期信

3、號通路相關基因發(fā)生了有意義的表達變化?；騾f(xié)同作用(Ep(t)值）分析發(fā)現(xiàn)，主要5條信號通路PI3K，STAT3，鈣蛋白酶，RHO家族鳥苷酸激酶，VEGF等信號通路（依次對應于促進G1期，G1/S轉換期，S期，G2/M轉換期和M期周期）促進NIH3T3細胞周期進程，它們調(diào)節(jié)的G1期、G1/S期、S期、G2/M期和M期生理活性與上述信號傳導活動呈正相關。通過對芯片數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析，以c-OS和NKX2-5兩個基因為切入點，用慢病毒轉染法對NI