從轉(zhuǎn)錄水平研究NIH3T3細(xì)胞周期進(jìn)程中基因表達(dá)的差異與功能.pdf

1、為從轉(zhuǎn)錄水平研究永生化的小鼠成纖維細(xì)胞NIH3T3細(xì)胞周期進(jìn)程中的基因表達(dá)差異與功能，本文通過(guò)血清饑餓法建立NIH3T3細(xì)胞周期模型，用Mouse Genome4302.0芯片檢測(cè)細(xì)胞周期過(guò)程中相關(guān)基因的表達(dá)豐度，用IPA軟件、QIAGEN和KEGGPATHWAY等網(wǎng)站資料分析基因表達(dá)變化預(yù)示的信號(hào)通路對(duì)細(xì)胞周期進(jìn)程的調(diào)節(jié)作用，并以c-FOS和NKX2-5為切入點(diǎn)，對(duì)NIH3T3細(xì)胞進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染，初步探究二者對(duì)小鼠成纖維細(xì)胞周期的調(diào)控

2、作用影響。芯片數(shù)據(jù)分析表明，2349個(gè)基因的ratio值大于對(duì)照3倍，為上調(diào)基因。2255個(gè)基因的ratio值小于對(duì)照3倍，為下調(diào)基因。55個(gè)基因表達(dá)上下調(diào)。上述基因共計(jì)4659個(gè)，統(tǒng)稱為有意義表達(dá)變化基因。GO注釋分類表明，這些有意義表達(dá)變化的基因涉及細(xì)胞增殖和細(xì)胞周期等33種生理活動(dòng)。在這些有意義表達(dá)變化基因中，有891個(gè)基因?yàn)榧?xì)胞周期相關(guān)基因，其中的548個(gè)基因表達(dá)上調(diào)，336個(gè)基因表達(dá)下調(diào)，7個(gè)基因表現(xiàn)上下調(diào)。114個(gè)細(xì)胞周期信

3、號(hào)通路相關(guān)基因發(fā)生了有意義的表達(dá)變化?；騾f(xié)同作用(Ep(t)值）分析發(fā)現(xiàn)，主要5條信號(hào)通路PI3K，STAT3，鈣蛋白酶，RHO家族鳥苷酸激酶，VEGF等信號(hào)通路（依次對(duì)應(yīng)于促進(jìn)G1期，G1/S轉(zhuǎn)換期，S期，G2/M轉(zhuǎn)換期和M期周期）促進(jìn)NIH3T3細(xì)胞周期進(jìn)程，它們調(diào)節(jié)的G1期、G1/S期、S期、G2/M期和M期生理活性與上述信號(hào)傳導(dǎo)活動(dòng)呈正相關(guān)。通過(guò)對(duì)芯片數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析，以c-OS和NKX2-5兩個(gè)基因?yàn)榍腥朦c(diǎn)，用慢病毒轉(zhuǎn)染法對(duì)NI