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1、哈爾濱醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文耐MTX小鼠NIH3T3細(xì)胞中DMs的分子結(jié)構(gòu)研究姓名:李明申請學(xué)位級別:博士專業(yè):遺傳學(xué)指導(dǎo)教師:傅松濱20100501哈爾濱醫(yī)科人學(xué)博l:學(xué)位論文ArchitecturesofDMsiUMTXresistantNIH3T3CellsatSequence—levelResolutionAbstractObjeetive:Doubleminutes(DMs)arecytogenetichallmarkbeari
2、ngextrachromosomallyamplifiedgenesincancercellsMethotrexate(MTX)resistantMousefibroblastlinesNIH3T3canmaintainDMsthatcontainDhfr(dihydrofolatereductase)geneDhfrisknowntelatetoMTXresistantMethod:First,wegotthegenome—widec
3、opynumberalterationofMTXresistantcellsbyarray—CGHSecond,theexpressionlevelsofgeneswithhighercopynumberweredetectedbyRealtimeRTPCRandWesternblotThen,integratedanalysisofexpressionandarrayCGHdatawasdonetofindthefunctionoft
4、hegeneswithhighercopynumberFollowing,DMswasseparatedbymicro—dissectionand、amplifiedbyDOP—PCR,andsequencesofDMswereidentifiedby454sequencingResults:AmpliconsofDMsarefrom5A1、10D2and13C3,includingPexl,Gatadl,4930511M11Rik,A
5、nkibl,Kritl,4932412H11Rik,MterfAkap9,Mdm2,Slc35e3,Nupl07,Rasg吐Msh3,DhfrAnkrd34band24930405M20RikTheregionsofamplificationareabout10MbandnearofthefragilesitesTheexpressionofGatadl,Ankibl,Kritl,MterfMdm2,S1c35e3,Msh3andDhf
6、rincreasedinMTXresistantcellsIntheampliconsofDMs,thegenedensityandGCpercentarehigherandtherepeatpercentislessthanthatofthemousegenomeLesshomologusrecombineationandlotsofnon—homologusrecombinationwerefoundinDMsConclusion:
7、DMsgenerationispossiblelyamulti—stepandmulti—eventprocessNonhomologousendjoiningmechanismwasindicatedtoplaytheleadingrolefortheDNAbreakpointsrejoiningduringDMsformationKeywords:MTX;DMs;non—homologusrecombination;drugresi
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