小鼠胚胎發(fā)育早中期卵黃囊基因表達(dá)譜的特點(diǎn)及功能探討.pdf

1、該研究所曾經(jīng)應(yīng)用PCR方法構(gòu)建了C57BL6小鼠E9.5、E12.5的卵黃囊和E12.5的胎肝3個(gè)cDNA文庫,并通過EST測(cè)序及生物信息學(xué)等手段描繪了它們的基因表達(dá)譜特點(diǎn),為我們理解胚胎發(fā)育過程中造血的起因提供了新線索.但是,通過建立文庫和測(cè)序的方法并不能很好地從量化上反映轉(zhuǎn)錄組的動(dòng)態(tài)變化特點(diǎn).為此,該研究擬應(yīng)用cDNA芯片技術(shù)及其先進(jìn)的生物信息學(xué)手段-CPP-SOM,來挖掘卵黃囊轉(zhuǎn)錄組在胚胎發(fā)育早中期的特點(diǎn)及其變化規(guī)律,篩選出參與、

2、調(diào)節(jié)卵黃囊造血、血管生成、營(yíng)養(yǎng)、代謝等生理功能的關(guān)鍵基因,從而為進(jìn)一步深入研究人類血液性重大疾病奠定基礎(chǔ).通過比較這一系列樣本的CPP-SOM可以動(dòng)態(tài)性地跟蹤卵黃囊在造血和血管生成過程中基因表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的整體性變化.在所研究的8,722個(gè)基因當(dāng)中,有3,121個(gè)基因被展示出來.根據(jù)CPP-SOM的功能分類結(jié)果,這些基因主要分為:結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)相關(guān)、物質(zhì)能量代謝、物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、增殖凋亡、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、造血、血管發(fā)育、血栓及氧化還原等九個(gè)類別.這些功能性集

3、團(tuán)如實(shí)地反映了卵黃囊在造血及血管生成中的主要功能性分子網(wǎng)絡(luò).結(jié)合卵黃囊在不同發(fā)育時(shí)期的生物學(xué)特征,可以推測(cè):1胚胎發(fā)育早中期,即E9.5~E13.5期間,卵黃囊的能量代謝以有氧氧化為主.2卵黃囊合成多種運(yùn)輸?shù)鞍?向胎體提供營(yíng)養(yǎng)供給.3卵黃囊的增殖活性下降,但局部有活躍的增殖群落,它們可能是造血細(xì)胞和血管生成相關(guān)的細(xì)胞.4造血干祖細(xì)胞早期被滯留于卵黃囊血管中,并迅速增殖,在E10.5之后才隨血流轉(zhuǎn)入胎體.5紅系造血活躍,分為原始、定向兩個(gè)