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1、近年來(lái),隨著宏基因組技術(shù)的出現(xiàn)和廣泛使用,顯著拓展了人們對(duì)環(huán)境微生物多樣性的認(rèn)識(shí)。宏基因組技術(shù)是指不經(jīng)過(guò)微生物培養(yǎng),直接提取環(huán)境微生物的總基因組的技術(shù)。使用該技術(shù),對(duì)原本在環(huán)境中超過(guò)99%的不可培養(yǎng)微生物基因的操作和研究成為了現(xiàn)實(shí),這促使人們發(fā)現(xiàn)了大量具有價(jià)值的新的蛋白和活性小分子物質(zhì)。
本課題研究采用宏基因組技術(shù),針對(duì)來(lái)源于貴州銅仁梵凈山的土壤微生物樣本,構(gòu)建了一個(gè)庫(kù)容克隆數(shù)量達(dá)到5×104的宏基因組文庫(kù)?;谌∷岣视?/p>
2、酯水解生成透明圈的功能篩選方法,從文庫(kù)中分離出新酯酶全長(zhǎng)基因1條(命名為EstC23)。進(jìn)化關(guān)系分析表明,該酶隸屬于脂肪酶第Ⅳ家族(Hormone-sensitivelipase family,HSL)。對(duì)該基因的異源過(guò)表達(dá)研究表明,該基因在T7強(qiáng)啟動(dòng)子作用下,產(chǎn)生的可溶性蛋白占細(xì)胞總蛋白量的30%左右。純酶蛋白的酶學(xué)性質(zhì)表征顯示,EstC23在25℃pH8.0條件下,對(duì)pNP-butyrat的酶活達(dá)254 U mg-1,該酶的最適反應(yīng)
3、溫度為40℃,特別是在5-10℃低溫下仍能維持最大活性的50%。EstC23在濃度達(dá)50%(V/V)的非極性有機(jī)溶劑(高logP)中顯現(xiàn)出極強(qiáng)的穩(wěn)定性,尤其在50%(V/V)的苯類(lèi)和烷烴類(lèi)有機(jī)溶劑中,其活力能提升至92%至274%之間,孵育一周后酶活性不會(huì)降低。同時(shí),酯酶EstC23能水解叔醇酯底物,這是通常的酯酶或脂肪酶不具備的底物活性。這些結(jié)果表明,EstC23在酯合成、手性化合物的拆分、不穩(wěn)定中間體化合物合成、肽合成等方面具有潛在
4、應(yīng)用價(jià)值。
后續(xù)我們以EstC23核酸序列為基礎(chǔ)設(shè)計(jì)特異性引物,基于宏基因組特異性PCR技術(shù)(Metageno mic Gene Specific PCR,MGS-PCR)和截?cái)嗪昊蚪M特異性PCR技術(shù)(Truncated Metagenomic Gene Specific PCR,TMGS-PCR),對(duì)來(lái)自全國(guó)不同地域環(huán)境的65組宏基因組DNA進(jìn)行序列篩選,分別獲得了同源家族全長(zhǎng)功能基因7條和核心片段15條,序列分析比對(duì)
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