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文檔簡介
1、東北農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文來源于Pedobactersp.MJ11的α半乳糖苷酶基因克隆、表達及其性質研究姓名:劉小丹申請學位級別:碩士專業(yè):微生物學指導教師:許修宏20090612AbstractIIIGeneCloningExpressionacterizationofαgalactosidasefromPedobactersp.MJ11AbstractαGalactosidasemelibiase(αDgalactosidegala
2、ctohydrolaseEC3.2.1.22)isanexoglycosidasethatcatalyticallyremovesαlinkedterminalnonreducinggalactoseresiduesindifferentsubstrates.αGalactosidasewaswidelydistributedinanimalsplantsmicroganisms.microganismwasthemainsources
3、ofthisenzymeftheirvariousspecieswidelydistributionstronglyadaption.Basedontheaminoacidsequencesimilaritiesαgalactosidaseshavebeenclassifiedintoglycosidehydrolase(GH)familiesof4273657.TheGH27GH36familiescontainthemajityof
4、knownαgalactosidases.MostαgalactosidasesofGH27arefromeukaryotethoseofGH36arefromprokaryote.αGalactosidaseshaveanumberofcommercialapplicationssuchasintheprocessingoffoodproductanimalfeedprocessingmedicinechemicalindustrys
5、oon.Atpresenttherearetwomainproblemsinthestudyofαgalactosidases:oneisdiscoveryofenzymewithgoodpropertiesanotherishighlevelexpressionofαgalactosidasetoscaletheproductionsolveproblemsinapplication.Inthisstudybyusingbioinfm
6、aticalmethodtheaminoacidsequenceofmicrobialαgalactosidasesfromglycosidehydrolase(GH)familie36withmolecularweightwithintherange7080kDawerealignedanalyzed.TwoconservativemotifDDGWEPEMwerechosentodesigneddegeneratedprimers.
7、FragmentofαgalactosidasewasclonedfromPedobactersp.MJ11byusingdegeneratedPCRmethodthefulllengthgenewasobtainedwithTAILPCRcloningmethods.TheαgalactosidasegeneofPedobactersp.MJ11wassubjecttoheterogeneousexpressioninEscheric
8、hiacoliBL21(DE3)functionverificationpurificationacterization.Thegeneconsistedof2166nucleotidesencodingaproteinof721aminoacidsaterminalcodon.Theαgalactosidasegenewasassignedtofamily36oftheglycosylhydrolasesthededucedamino
9、acidsequencesharesthehighestidentityof54%withtheαgalactosidasefromBacteroidesthetaiotaomicron.Allthatindicatedhighnoveltyoftheαgalactosidasegenes.TheexpressedrecombinantenzymeAgaMJ11Hhasamolecularweightof8[AC3]0kDawhichi
10、sagreetothecalculatedmolecularweightofthematureenzymefromthededucedaminoacidsequenceofagaMJ11wasfurtheridentifiedbyMSbasedinternalsequenceanalysis.TheoptimumofpHtemperatureofthepurifiedenzymewas5.540Crespectivelytheenzym
11、ewasstableinrangeofpH4.0–10.0.Therecombinantenzymeshowedthehydrolyticactivityfoligomericsubstratessuchasraffinosestachyosemelibiose.TheKmfpNPGmelibioseweredeterminedas2.9422.37mMrespectively.[AC4]Thepurifiedenzymealsosho
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