抗生素糖基轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)發(fā)育及催化機(jī)理分析.pdf

1、糖基化反應(yīng)是由糖基轉(zhuǎn)移酶催化完成的，它對(duì)于抗生素等生物次級(jí)代謝產(chǎn)物發(fā)揮其生物活性有著十分重要的影響。在一些有著特殊性質(zhì)的抗生素糖基轉(zhuǎn)移酶(AGt)的催化下，各種初級(jí)代謝中不常見(jiàn)的脫氧糖基被連接到抗生素糖苷配基上，使其能夠很好地發(fā)揮生物功能。本文對(duì)目前收集到的所有AGt氨基酸序列進(jìn)行全面細(xì)致的相似性搜索，并利用鄰接法、最大似然法和Bayesian法對(duì)GT-1成員進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示，多烯大環(huán)內(nèi)酯AGt與其它聚酮AGt存在

2、比較明顯的進(jìn)化差異，卻更接近一些真核來(lái)源的糖基轉(zhuǎn)移酶，結(jié)合多種序列分析手段推測(cè)其可能是來(lái)自真核的水平基因轉(zhuǎn)移的產(chǎn)物。以上結(jié)論同時(shí)得到了基于結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果的支持。蛋白三維結(jié)構(gòu)的比對(duì)揭示了Gtf-蛋白與MurG蛋白之間存在的進(jìn)化關(guān)聯(lián)，后者是一種參與細(xì)菌細(xì)胞壁形成的重要糖基轉(zhuǎn)移酶。根據(jù)Gtf-蛋白系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果，整個(gè)糖肽類抗生素生物合成基因簇之間的進(jìn)化關(guān)系也得到了推測(cè)。另一方面，基于以結(jié)構(gòu)比對(duì)為基礎(chǔ)的氨基酸序列比對(duì)結(jié)果，本文對(duì)多