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文檔簡介
1、糖基化反應(yīng)是由糖基轉(zhuǎn)移酶催化完成的,它對于抗生素等生物次級代謝產(chǎn)物發(fā)揮其生物活性有著十分重要的影響。在一些有著特殊性質(zhì)的抗生素糖基轉(zhuǎn)移酶(AGt)的催化下,各種初級代謝中不常見的脫氧糖基被連接到抗生素糖苷配基上,使其能夠很好地發(fā)揮生物功能。本文對目前收集到的所有AGt氨基酸序列進行全面細致的相似性搜索,并利用鄰接法、最大似然法和Bayesian法對GT-1成員進行系統(tǒng)發(fā)育分析。構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,多烯大環(huán)內(nèi)酯AGt與其它聚酮AGt存在
2、比較明顯的進化差異,卻更接近一些真核來源的糖基轉(zhuǎn)移酶,結(jié)合多種序列分析手段推測其可能是來自真核的水平基因轉(zhuǎn)移的產(chǎn)物。以上結(jié)論同時得到了基于結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果的支持。蛋白三維結(jié)構(gòu)的比對揭示了Gtf-蛋白與MurG蛋白之間存在的進化關(guān)聯(lián),后者是一種參與細菌細胞壁形成的重要糖基轉(zhuǎn)移酶。根據(jù)Gtf-蛋白系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果,整個糖肽類抗生素生物合成基因簇之間的進化關(guān)系也得到了推測。另一方面,基于以結(jié)構(gòu)比對為基礎(chǔ)的氨基酸序列比對結(jié)果,本文對多
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