廣西高致病性豬繁殖與呼吸綜合征的流行病學(xué)調(diào)查及其病毒ORF5、ORF6、ORF7基因的克隆與序列分析.pdf

1、廣西大學(xué)碩士學(xué)位論文廣西高致病性豬繁殖與呼吸綜合征的流行病學(xué)調(diào)查及其病毒ORF5、ORF6、ORF7基因的克隆與序列分析姓名：劉芳申請學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：傳染病與分子免疫學(xué)指導(dǎo)教師：陸芹章200806039 3 ．卜9 6 ．6 ％、8 8 ．7 —9 7 ．6 ％。從E 蛋白的變異來看，本次獲得的毒株與時(shí)間間隔最長的亞群I 的2 0 0 2 年廣西分離株G X A 核苷酸同源性為8 8 ．4 - 8 9 ．6 ％，氨基酸同源性為8 6

2、 ．卜8 7 ．6 ％；與亞群I I 的G ×W ×毒株的核苷酸和氨基酸同源性分另I J 為8 9 ．1 —9 0 ．5 ％年Ⅱ8 8 ．6 —9 0 ．5 ％，但與J X A l 、H U B 2 、H E B l 、H u N 株的核苷酸和氨基酸的同源性很高，分別高達(dá)9 8 ．5 —9 9 ．7 ％、9 7 ．5 —9 9 ．5 ％。這說明廣西2 0 0 6 年后流行的P R R S V 較以前的毒株有了較大程度

3、的變異，并與高致病性的J X A l 、H U B 2 、H E B l 、H u N 株的同源性非常高。與國內(nèi)外的P R R S 毒株比較，在推導(dǎo)編碼的氨基酸序列中，本研究的1 8 個(gè)毒株的E 蛋白氨基酸的變異主要集中在2 4 —3 9 a a 、5 8 —6 6 a a 、9 2 —1 0 4 a a 、1 6 卜1 6 4 a a 、1 8 5 —2 0 0 a a ；M蛋白的氨基酸變異主要發(fā)生在1 0 a a ，6 3 —7 0

4、 a a ，N 蛋白的氨基酸變異主要集中在4 6 a a 、9 1 a a 、1 0 9 a a 及1 1 7 a a 位點(diǎn)。k通過遺傳進(jìn)化樹分析，1 8 個(gè)廣西P R R S 流行毒株與C H 一1 a 株同屬于亞群、． I I ，并與國內(nèi)流行的高致病性P R R S 變異毒株J X A l 、H U B 2 、、H E B l 、H u N 株親緣關(guān)系較近，同處于一個(gè)小分支，可能來源于同一個(gè)毒株。關(guān)鍵詞：高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病