ATM基因單體型與小細(xì)胞肺癌患者遺傳易感性及化療效果關(guān)聯(lián)的初步研究.pdf

1、目的：探討了ATM基因的標(biāo)簽SNP和單體型與小細(xì)胞肺癌患者發(fā)病風(fēng)險以及化療效果的關(guān)系。 方法：采用基于生物信息學(xué)的多階段病例．對照研究策略，首先利用SNP公共數(shù)據(jù)庫資源構(gòu)建了我國人群中ATM全基因的常見單體型，并選擇標(biāo)簽SNP；用病例．對照關(guān)聯(lián)分析的方法分析了254例小細(xì)胞肺癌患者和262例健康對照中aTM基因標(biāo)簽SNP和常見單體型的分布規(guī)律；同時分析了上述遺傳多態(tài)性與172例進行鉑類為主方案化療的小細(xì)胞肺癌患者近期療效及生存期

2、的關(guān)系。分型方法采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法。以非條件Logistc回歸模型計算標(biāo)簽SNP各基因型的病例．對照比值比(OR)及其95％可信區(qū)間(CI)，用Haploview程序計算常見單體型頻率及并比較其在病例對照組間的差異；化療近期有效率采用x<'2>檢驗，Kaplan-Meier法比較不同基因型的無進展生存率(progession free survival，PFS)和總生存率(overall su

3、rvival，OS)的差異。 結(jié)果：共檢索到ATM基因的58個常見SNP位點，構(gòu)建了三個常見單體型，據(jù)此選擇了4個標(biāo)簽SNP。病例-對照分析結(jié)果顯示：在3種常見單體型中，Hap2的頻率在SCLC組(65.7：214.3)低于對照組(119.7：228.3)，存在顯著性差異(P=0.003)；用排列檢驗法(permutation test)校正重復(fù)檢驗后(P值的模擬次數(shù)設(shè)定為1000)，此差異仍具有統(tǒng)計學(xué)顯著性(P=0.03)。在

4、療效研究中，發(fā)現(xiàn)標(biāo)簽SNP TAG4 G等位基因攜帶者(TGr+GG)治療后的中位PFS為11個月(95％CI：9-13)，明顯長于TT基因型(中位PFS為8個月95％CI：6-10)，兩種基因型的累積無進展生存率具有統(tǒng)計學(xué)顯著性差異(Log-rank P=0.04)，OR值為0.69(95％CI：0.48-0.99)。在121例化療方案統(tǒng)一(CE方案)的患者中該多態(tài)不同基因型的無進展生存率也具有顯著性差異(Log-rankP=0.02