兒童呼吸道合胞病毒流行特征及序列分析.pdf

1、背景：
　　急性呼吸道感染（acute respiratory tract infection，ARTI）是人類最常見的傳染性疾病之一，發(fā)病率高，也是兒童發(fā)病和死亡的重要原因。呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus，RSV）是引起世界范圍內(nèi)嬰幼兒下呼吸道感染的重要病原體。
　　目的：
　　了解廣州地區(qū)2011年至2013年急性呼吸道感染患兒中呼吸道合胞病毒的流行病學(xué)特征，分析呼吸道合胞病

2、毒的陽性率與季節(jié)氣候因素的關(guān)系。通過對呼吸道合胞病毒基因特征分析，了解該病毒的起源、進(jìn)化和流行株等信息，為臨床預(yù)防與診斷提供參考依據(jù)。
　　方法：
　　1.2011年1月至2013年12月，在廣州市婦女兒童醫(yī)療中心采集因急性呼吸道感染就診的14歲以下患兒咽拭子樣本27116例，用熒光RT-PCR法檢測RSV。
　　2．每年隨機選取10例（共30例）RSV陽性樣本，擴增其G基因。
　　3．從30例RSV陽性樣本中隨

3、機選取3例擴增RSV基因組全長。
　　4．將獲得的RSV G基因及RSV全基因組陽性擴增產(chǎn)物進(jìn)行序列測定，采用ClustalW2.1、MEGA5.2、DNASTAR Lasergege7、MegAlign、NetOGlyc4.0和NetNGlyc1.0等軟件對序列進(jìn)行氨基酸序列比對、同源性分析、遺傳進(jìn)化分析和糖基化位點分析。
　　結(jié)果：
　　1．27116例急性呼吸道感染患兒咽拭子標(biāo)本中，RSV總檢出率為16.30％（

4、4421/27116）。2011年至2013年陽性率分別為24.43%（2493/10205）、16.80%（1391/8281）和6.22%（537/8630）。男女比例2.33：1。
　　2．2011年RSV的總體感染率較高，流行高峰為1~4月和7~9月；2012年的流行高峰為1~4月；2013年RSV的總體感染率較低，流行高峰在1月。
　　3．RSV患兒在急性呼吸道感染病例中的年齡分布情況，0~6個月、6個月~1歲、1

5、~2歲、2~5歲及5~14歲年齡段RSV檢出率分別為22.00%（2335/10614），19.63%（1030/5248），14.89%（629/4223），8.08%（391/4842）和1.64%（36/2189）。
　　4．RSV測序的30例中，23株A亞型之間G基因核苷酸同源性為89.6%~100%，氨基酸同源性為95.3%~100%；其中21株屬于NA1型，2株屬于ON1型。7株B亞型之間G基因核苷酸同源性為98.6%

6、~99.7%，氨基酸同源性為97.7%~100%，均屬于BA9型。
　　5．27株RSV G基因的登陸號是：KM586819~KM586845。
　　6．3株RSV全基因組的登陸號是：KM517572，KM578843和KM517573；其全長分別是15204 bp、15205 bp和15276 bp。
　　7．G基因第二高變區(qū)的潛在N-糖基化位點：A亞型存在4個位點（237、251、273和294位），B亞型存在2個

7、位點（294和308位）。
　　8．G基因第二高變區(qū)的潛在O-糖基化位點：NA1型有32~35個，ON1型有43個；BA9型有42~45個。
　　結(jié)論：
　　2011年至2013年呼吸道合胞病毒仍然是引起廣州地區(qū)兒童急性呼吸道感染的重要病原體，流行季節(jié)以冬春季和夏季為主。2歲以下兒童是呼吸道合胞病毒感染的主要對象。隨著兒童年齡的增長，呼吸道合胞病毒感染率呈下降趨勢。男孩比女孩更為易感。NA1型和BA9型分別是A、B亞型