優(yōu)質雞MyD88基因多態(tài)性及其與白痢易感性的關聯(lián)分析.pdf

1、雞白痢是一種嚴重威脅現(xiàn)代家禽養(yǎng)殖業(yè)的細菌性疾病，該病不僅可造成雛雞的大規(guī)模死亡，同時隱性感染使得感染雞生長遲緩、生產(chǎn)性狀降低等，從而給養(yǎng)殖業(yè)造成重大的經(jīng)濟損失。養(yǎng)殖場主要疫苗接種和添加抗生素等藥物的方法對其進行防治，同時也造成了致病菌耐藥升高和禽產(chǎn)品抗生素殘留等問題。隨著研究的不斷深入，人們發(fā)現(xiàn)雞白痢的發(fā)生與個體的遺傳因素相關。已有研究表明，NRAMP1、TLR4及MHC等基因多態(tài)性與抗雞白痢沙門氏菌性狀相關聯(lián)。MyD88基因作為先天免

2、疫通路中的一種重要的銜接蛋白，在免疫應答反應中發(fā)揮著重要作用。但是MyD88基因的多態(tài)性與雞白痢疾病的關系卻尚未見報道。
　　為了探究雞MyD88基因的多態(tài)性和雞白痢沙門氏菌易感性之間的關聯(lián)性分析。本試驗基于病例-對照試驗設計，以二郎山山地雞為試驗材料，采集陽性雞樣本血樣128份，陰性雞血樣156份，共284份血樣提取全基因組DNA，采用制作DNA池進行直接測序的方法篩選MyD88基因CDS區(qū)的變異位點，然后對采集的所有樣本進行直

3、接測序來檢測MyD88基因CDS區(qū)的單核苷酸多態(tài)性，并進行基因分型，最后使用SPASS21.0軟件和Hploview4.2軟件分別進行等位基因頻率和基因型頻率分析、單倍型組構建和單倍型分析。結果發(fā)現(xiàn):
　　通過對目的片段測序，在第5外顯子501bp的片段中一共發(fā)現(xiàn)8個SNP，其中7個SNP為已知的SNP，一個是新發(fā)現(xiàn)的SNP，為SNP8(G1116T)。并且只有SNP1(c.934C＞T)的等位基因頻率在患病-對照組中差異顯著(P

4、＜0.05)，SNP1(c.934C＞T)、SNP3(c.1001G＞T)兩個突變位點的基因型頻率在病例-對照組中的差異顯著(P＜0.05); SNP1(c.934C＞T)、SNP3(c.1001G＞T)、SNP4(c.1010T＞C)位點構成的單倍型在雞白痢病例-對照組中差異極顯著(P＜0.01);同時，SNP5(c.1020 G＞A)、SNP6(c.1037 G＞C)、SNP7(c.1096 A＞G)、SNP8(c.1116G＞T)