MyD88基因3’-UTR多態(tài)性與雞白痢沙門氏菌抗性關(guān)聯(lián)性分析.pdf

1、雞白痢沙門氏菌是現(xiàn)代養(yǎng)禽業(yè)中最普遍的細(xì)菌性疾病之一。目前，控制雞白痢感染的手段主要有接種疫苗，藥物控制和消除凈化，但這些方法都有短板。隨著抗病育種工作的開展，通過與分子標(biāo)記聯(lián)合選育品種的手段，從遺傳水平上篩選先天抗病能力強的群體是對抗病原菌感染最深入有效的方法之一。機體感染雞白痢沙門氏菌會觸發(fā)先天性免疫通路。其中MyD88作為TLR家族信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路上最重要的一個銜接蛋白，在抗菌感染相關(guān)的研究中受到廣泛關(guān)注。有研究表明，雞群在感染雞白痢沙

2、門氏菌后，MyD88基因表達(dá)水平上調(diào)，但其mRNA轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的機制并未見報道。3'-UTR中的AREs是調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄后表達(dá)的功能性元件。AREs通過調(diào)節(jié)mRNA穩(wěn)定性和翻譯效率來調(diào)控蛋白的生物學(xué)活性是近年的研究熱點。而MyD88基因的3'-UTR與機體是否易感雞白痢沙門氏菌的關(guān)系尚未見報道。
　　為了探索MyD88基因的3'-UTR中單核苷酸多態(tài)性是否與抗雞白痢沙門氏菌感染相關(guān)，我們對優(yōu)質(zhì)SD雞連續(xù)兩個世代，SD04世代和SD05

3、世代進(jìn)行了遺傳關(guān)聯(lián)研究。兩個世代共4，400只300日齡種母雞經(jīng)全血平板凝集檢驗雞白痢沙門氏菌后，將陽性個體集成2個病例組，分別包含SD04世代81例，SD05世代61例;陰性個體集成2個對照組，分別包含SD04世代90例，SD05世代66例。所有樣本血樣靜脈翅下采取，然后采用苯-氯仿萃取法提取全基因DNA，擴(kuò)增樣本MyD88基因的3'-UTR區(qū)域片段，測序后篩選單核苷酸多態(tài)性位點。通過R軟件對同世代SNP進(jìn)行卡方檢驗，對比兩個世代間位

4、點、等位基因頻率和基因型頻率在病例-對照組中分布的差異性。同時，對SNP位點構(gòu)建的單倍型進(jìn)行關(guān)聯(lián)雞白痢抗病性分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn):
　　1.兩個世代共篩選出13個SNP，其中10個SNP符合哈迪-溫伯格平衡。SD04世代中SNP4(g.4810293 C＞A)等位基因頻率和基因型頻率在病例-對照組之間分布都存在顯著差異(p＜0.05)。并且，SNP4的OR值等于0.6088，95％CI為0.531-0.9759，說明該位點對感染雞白痢沙

5、門氏菌有抵抗作用。SD05世代中只有SNP13等位基因在病例對照組之間分布存在顯著差異(p＜0.05)，并且SNP13的OR值為1.8012，95％CI為1.0247-1.4827，說明SNP13對雞白痢沙門氏菌易感。
　　2.SD04世代中SNP1、SNP2(g.4810266A＞G，g.4810372 C＞T)組成的單倍型GG，AA，以及SD05世代中SNP1、SNP2和 SNP11組成的單倍型GTG、ACA、GCG、ACG和

6、GCA，在病例對照中分布不存在顯著差異(p＞0.05)。但SD04世代中位點 g.4810266 A＞G與g.4810372 C＞T;位點SNP5(g.4810191 A＞G)和SNP6(g.4810253A＞G)與位點SNP7(g.4810276 C＞T)，g.4810293 C＞A，SNP8(g.4810352 C＞T)均存在強連鎖不平衡，與SD05世代不同，連鎖不平衡被削弱，說明SD04世代陽性個體的淘汰改變了SD05世代雞白痢沙