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文檔簡介
1、目的:鼠雙微基因(Mouse double mimute2,MDM2)是一種與人類惡性腫瘤發(fā)病風險密切相關的癌基因。本實驗將通過病例-對照研究方法,探討MDM2基因的rs2279744及rs117039649兩個位點的單核苷酸多態(tài)性與結直腸癌發(fā)病風險之間的關系,希望能為結直腸癌的早期診斷和治療在分子生物學水平上提供一定的理論依據。
方法:選取在2014年2月-2016年2月間就診于河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院的結直腸癌患者共371例(
2、其中直腸癌患者209例、結腸癌患者162例)作為實驗組和健康人群199例作為對照組,運用病例-對照研究方法對其進行研究。運用蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法對外周血白細胞中的DNA進行提取,采用聚合酶鏈反應-連接酶檢測反應(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction, PCR-LDR)方法對 MDM2基因的rs2279744及 rs117039649兩個位點單核甘酸多態(tài)性的等位基
3、因及基因型頻率分布情況進行檢測。
使用SPSS13.0版軟件包(SPSS Company,Chicago,Illionis,USA)對所得到的實驗數據進行統(tǒng)計學分析。運用t檢驗分別對結腸癌組、直腸癌組與健康對照組之間的年齡情況是否存在差異進行統(tǒng)計學分析;并運用χ2檢驗分別對結腸癌組、直腸癌組與健康對照組的性別差異、等位基因分布頻率及基因型分布頻率是否存在統(tǒng)計學差異進行分析。利用Hardy-Weinberg對兩個組別基因型頻率的
4、分布進行連鎖平衡分析。應用Logistic回歸法計算比值比(odds ratio, OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval, CI)。
結果:
1對MDM2基因rs2279744及rs117039649兩位點在健康對照組人群中的基因型頻率應用Hardy-weinberg定律方法進行遺傳平衡檢測,其結果說明該人群符合遺傳平衡法則(P>0.05)。
2 MDM2基因rs2279744位點
5、的G和T等位基因在健康對照組和直腸癌病例組中的分布頻率分別為:59.29%、40.71%和67.70%、32.30%,兩組數據之間比較,其P值為0.01,P<0.05,差異有統(tǒng)計學意義;MDM2基因rs2279744位點的G和T等位基因在健康對照組和結腸癌病例組中的頻率分別為:59.29%、40.71%和67.90%、32.10%,兩組數據之間比較,其P值為0.01,P<0.05,差異有統(tǒng)計學意義。MDM2基因rs2279744位點的G
6、G、GT、TT基因型在健康對照組和直腸癌病例組中所占頻率分別為:35.18%、48.24%、16.58%和53.59%、28.23%、18.18%,兩組通過OR分析得出:GG基因型與 GT基因型相比,其 OR=2.603,95%CI=1.68-4.05;TT基因型與 GT基因型相比,其 OR=1.874,95%CI=1.06-3.31,提示GG基因型及TT基因型均可增加直腸癌發(fā)病的風險。MDM2基因rs2279744位點的GG、GT、T
7、T基因型在健康對照組和結腸癌病例組中所占頻率分別為:35.18%、48.24%、16.58%和54.32%、27.16%、18.52%,兩組通過OR分析得出:GG基因型與GT基因型相比,其 OR=2.743,95% CI=1.71-4.41;TT基因型與 GT基因型相比,其OR=1.983,95%CI=1.08-3.56,提示 GG基因型及 TT基因型均可增加結腸癌發(fā)病的風險。
3 MDM2基因rs117039649位點的G和
8、C等位基因在健康對照組和結腸癌病例組中的分布頻率分別為:98.74%、1.26%和98.77%、1.23%,兩組數據之間比較,其P值為0.97,P>0.05,差異無統(tǒng)計學意義。MDM2基因rs117039649位點的G和C等位基因在健康對照組和直腸癌病例組中的分布頻率分別為:98.74%、1.26%和99.28%、0.72%,兩組數據之間比較,其P值為0.43,P>0.05,差異無統(tǒng)計學意義。MDM2基因rs117039649位點的GG
9、和GC基因型在健康對照組和直腸癌病例組中的頻率分別為:97.98%、2.02%和98.56%、1.44%,兩組通過OR分析得出:GC基因型與GG基因型相比,其OR=0.565,95%CI=0.13-2.39,提示GC基因型可能與直腸癌的發(fā)病之間無明顯相關性。MDM2基因 rs117039649位點的GG和GC基因型在健康對照組和結腸癌病例組中的頻率分別為:97.98%、2.02%和97.53%、2.47%,兩組通過OR分析得出:GC基因
10、型與GG基因型相比,其OR=0.982,95%CI=0.26-3.72,提示GC基因型可能與結腸癌的發(fā)病之間無明顯相關性。
4運用軟件(EH和2LD)對MDM2基因的rs2279744和rs117039649兩位點之間進行聯(lián)合分析后發(fā)現(xiàn):在直腸癌病例組中兩位點之間符合連鎖不平衡關系(D'=0.492),其中在對照組中rs2279744G-rs117039649G單體型所占頻率為59.04%,為最常見的單體型,其次為rs2279
11、744T-rs117039649G單體型(39.70%)、rs2279744T-rs117039649C單體型(1.01%)和rs2279744G-rs117039649C單體型(0.25%)。人群中rs2279744G-rs117039649G單體型可能增加直腸癌發(fā)病的風險(OR=1.438,95%CI=1.08-1.92)。rs2279744T-rs117039649G單體型可能降低直腸癌發(fā)病的風險(OR=0.709,95%CI=0
12、.53-0.95)。人群中rs2279744G-rs117039649C單體型和rs2279744T-rs117039649C單體型可能與直腸癌的發(fā)病風險之間無相關性。在結腸組中兩位點之間存在連鎖不平衡關系(D'=0.021)。人群中rs2279744G-rs117039649G單體型可能增加結腸癌發(fā)病的風險( OR=1.447,95%CI=1.07-1.97)。rs2279744T-rs117039649G單體型可能降低結腸癌發(fā)病的風
13、險(OR=0.688,95%CI=0.51-0.94)。rs2279744G-rs117039649C單體型和rs2279744T-rs117039649C單體型可能與結腸癌發(fā)病的風險之間無相關性。
結論:
1 MDM2基因rs2279744位點的基因多態(tài)性可能與結直腸癌發(fā)病風險存在相關性,GG基因型和TT基因型與GT基因型相比均增加了結直腸癌的發(fā)病風險。
2 MDM2基因rs117039649位點的基因多
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