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1、目的:鼠雙微基因(Mouse double mimute2,MDM2)是一種與人類惡性腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)的癌基因。本實(shí)驗(yàn)將通過病例-對(duì)照研究方法,探討MDM2基因的rs2279744及rs117039649兩個(gè)位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系,希望能為結(jié)直腸癌的早期診斷和治療在分子生物學(xué)水平上提供一定的理論依據(jù)。
方法:選取在2014年2月-2016年2月間就診于河北醫(yī)科大學(xué)第四醫(yī)院的結(jié)直腸癌患者共371例(
2、其中直腸癌患者209例、結(jié)腸癌患者162例)作為實(shí)驗(yàn)組和健康人群199例作為對(duì)照組,運(yùn)用病例-對(duì)照研究方法對(duì)其進(jìn)行研究。運(yùn)用蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法對(duì)外周血白細(xì)胞中的DNA進(jìn)行提取,采用聚合酶鏈反應(yīng)-連接酶檢測(cè)反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction, PCR-LDR)方法對(duì) MDM2基因的rs2279744及 rs117039649兩個(gè)位點(diǎn)單核甘酸多態(tài)性的等位基
3、因及基因型頻率分布情況進(jìn)行檢測(cè)。
使用SPSS13.0版軟件包(SPSS Company,Chicago,Illionis,USA)對(duì)所得到的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。運(yùn)用t檢驗(yàn)分別對(duì)結(jié)腸癌組、直腸癌組與健康對(duì)照組之間的年齡情況是否存在差異進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析;并運(yùn)用χ2檢驗(yàn)分別對(duì)結(jié)腸癌組、直腸癌組與健康對(duì)照組的性別差異、等位基因分布頻率及基因型分布頻率是否存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異進(jìn)行分析。利用Hardy-Weinberg對(duì)兩個(gè)組別基因型頻率的
4、分布進(jìn)行連鎖平衡分析。應(yīng)用Logistic回歸法計(jì)算比值比(odds ratio, OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval, CI)。
結(jié)果:
1對(duì)MDM2基因rs2279744及rs117039649兩位點(diǎn)在健康對(duì)照組人群中的基因型頻率應(yīng)用Hardy-weinberg定律方法進(jìn)行遺傳平衡檢測(cè),其結(jié)果說明該人群符合遺傳平衡法則(P>0.05)。
2 MDM2基因rs2279744位點(diǎn)
5、的G和T等位基因在健康對(duì)照組和直腸癌病例組中的分布頻率分別為:59.29%、40.71%和67.70%、32.30%,兩組數(shù)據(jù)之間比較,其P值為0.01,P<0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;MDM2基因rs2279744位點(diǎn)的G和T等位基因在健康對(duì)照組和結(jié)腸癌病例組中的頻率分別為:59.29%、40.71%和67.90%、32.10%,兩組數(shù)據(jù)之間比較,其P值為0.01,P<0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。MDM2基因rs2279744位點(diǎn)的G
6、G、GT、TT基因型在健康對(duì)照組和直腸癌病例組中所占頻率分別為:35.18%、48.24%、16.58%和53.59%、28.23%、18.18%,兩組通過OR分析得出:GG基因型與 GT基因型相比,其 OR=2.603,95%CI=1.68-4.05;TT基因型與 GT基因型相比,其 OR=1.874,95%CI=1.06-3.31,提示GG基因型及TT基因型均可增加直腸癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)。MDM2基因rs2279744位點(diǎn)的GG、GT、T
7、T基因型在健康對(duì)照組和結(jié)腸癌病例組中所占頻率分別為:35.18%、48.24%、16.58%和54.32%、27.16%、18.52%,兩組通過OR分析得出:GG基因型與GT基因型相比,其 OR=2.743,95% CI=1.71-4.41;TT基因型與 GT基因型相比,其OR=1.983,95%CI=1.08-3.56,提示 GG基因型及 TT基因型均可增加結(jié)腸癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)。
3 MDM2基因rs117039649位點(diǎn)的G和
8、C等位基因在健康對(duì)照組和結(jié)腸癌病例組中的分布頻率分別為:98.74%、1.26%和98.77%、1.23%,兩組數(shù)據(jù)之間比較,其P值為0.97,P>0.05,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。MDM2基因rs117039649位點(diǎn)的G和C等位基因在健康對(duì)照組和直腸癌病例組中的分布頻率分別為:98.74%、1.26%和99.28%、0.72%,兩組數(shù)據(jù)之間比較,其P值為0.43,P>0.05,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。MDM2基因rs117039649位點(diǎn)的GG
9、和GC基因型在健康對(duì)照組和直腸癌病例組中的頻率分別為:97.98%、2.02%和98.56%、1.44%,兩組通過OR分析得出:GC基因型與GG基因型相比,其OR=0.565,95%CI=0.13-2.39,提示GC基因型可能與直腸癌的發(fā)病之間無明顯相關(guān)性。MDM2基因 rs117039649位點(diǎn)的GG和GC基因型在健康對(duì)照組和結(jié)腸癌病例組中的頻率分別為:97.98%、2.02%和97.53%、2.47%,兩組通過OR分析得出:GC基因
10、型與GG基因型相比,其OR=0.982,95%CI=0.26-3.72,提示GC基因型可能與結(jié)腸癌的發(fā)病之間無明顯相關(guān)性。
4運(yùn)用軟件(EH和2LD)對(duì)MDM2基因的rs2279744和rs117039649兩位點(diǎn)之間進(jìn)行聯(lián)合分析后發(fā)現(xiàn):在直腸癌病例組中兩位點(diǎn)之間符合連鎖不平衡關(guān)系(D'=0.492),其中在對(duì)照組中rs2279744G-rs117039649G單體型所占頻率為59.04%,為最常見的單體型,其次為rs2279
11、744T-rs117039649G單體型(39.70%)、rs2279744T-rs117039649C單體型(1.01%)和rs2279744G-rs117039649C單體型(0.25%)。人群中rs2279744G-rs117039649G單體型可能增加直腸癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.438,95%CI=1.08-1.92)。rs2279744T-rs117039649G單體型可能降低直腸癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.709,95%CI=0
12、.53-0.95)。人群中rs2279744G-rs117039649C單體型和rs2279744T-rs117039649C單體型可能與直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間無相關(guān)性。在結(jié)腸組中兩位點(diǎn)之間存在連鎖不平衡關(guān)系(D'=0.021)。人群中rs2279744G-rs117039649G單體型可能增加結(jié)腸癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)( OR=1.447,95%CI=1.07-1.97)。rs2279744T-rs117039649G單體型可能降低結(jié)腸癌發(fā)病的風(fēng)
13、險(xiǎn)(OR=0.688,95%CI=0.51-0.94)。rs2279744G-rs117039649C單體型和rs2279744T-rs117039649C單體型可能與結(jié)腸癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)之間無相關(guān)性。
結(jié)論:
1 MDM2基因rs2279744位點(diǎn)的基因多態(tài)性可能與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在相關(guān)性,GG基因型和TT基因型與GT基因型相比均增加了結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
2 MDM2基因rs117039649位點(diǎn)的基因多
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