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文檔簡介
1、目的:
micC是一種編碼小分子非編碼RAN(small non-coding RNA,sRNA)的基因,存在于多種革蘭陰性細(xì)菌基因組內(nèi)。micC位于E.coli基因組ompN與ybdK基因之間,其中ompN與ybdK轉(zhuǎn)錄方向一致,而與micC轉(zhuǎn)錄方向相反。micC啟動(dòng)子位于ompN與micC基因間,長度為227個(gè)堿基對(duì)(base pair,bp)。該啟動(dòng)子是否具有雙向轉(zhuǎn)錄活性還未知曉,micC的應(yīng)激性表達(dá)仍有待進(jìn)一步探索。本
2、文對(duì)micC啟動(dòng)子的雙向轉(zhuǎn)錄活性、micC應(yīng)激性表達(dá)進(jìn)行了研究。
方法:
?。?)本研究以大腸埃希菌DH5為實(shí)驗(yàn)菌株,用天根生物科技公司產(chǎn)的試劑盒提取其基因組,以其為模板,設(shè)計(jì)引物分別擴(kuò)增micC基因227bp、485bp的5'側(cè)翼序列,并分別正向、反向連接到質(zhì)粒pJRS462表達(dá)β-葡萄糖苷酸酶(be ta-gluc uro nidase,gus)報(bào)告基因的上游構(gòu)建報(bào)告載體,檢測攜帶各報(bào)告載體菌株的GUS活性。
3、> ?。?)在實(shí)驗(yàn)(1)正反向啟動(dòng)子都有活性的情況下,利用Red重組系統(tǒng)將各啟動(dòng)子連同gus報(bào)告基因和卡那霉素抗性基因重組到DH5ɑ基因組上,對(duì)啟動(dòng)子特性進(jìn)行驗(yàn)證。
?。?)檢測各重組菌在各種應(yīng)激條件下的GUS活性,如溫度、酸堿度、滲透壓、抗生素、氧化應(yīng)激刺激等。
結(jié)果:
?。?)250bp和500bp的DNA片段正向、反向插入到質(zhì)粒gus報(bào)告基因上游后,均檢測出gus基因表達(dá),實(shí)驗(yàn)組GUS活性是陰性對(duì)照組的兩
4、倍以上。
(2)啟動(dòng)子連同gus基因和篩選標(biāo)記成功重組到DH5ɑ基因組上;重組菌進(jìn)入穩(wěn)定生長期后GUS活性大幅度提高。
?。?)在不同應(yīng)激環(huán)境下,各重組菌gus基因表達(dá)水平不盡相同:GUS活性隨著溫度升高而升高,隨著溫度的降低而降低;GUS活性隨著滲透壓的增高而降低;氧化應(yīng)激條件下,正向啟動(dòng)子誘導(dǎo)的GUS活性表達(dá)升高,而反向啟動(dòng)子GUS活性無顯著變化;在pH應(yīng)激下,GUS活性無明顯改變。
結(jié)論:
1
5、.介于micC與ompN基因間的DNA序列為一個(gè)雙向啟動(dòng)子。
2.同一長度的啟動(dòng)子其正、反向間的轉(zhuǎn)錄活性沒有差異。
3.細(xì)菌進(jìn)入穩(wěn)定期后micC啟動(dòng)子表達(dá)大幅度提高。
4. micC啟動(dòng)子主要受溫度和滲透壓刺激的調(diào)節(jié):在溫度升高時(shí),正反向啟動(dòng)子表達(dá)都增高,反之都降低;正反向啟動(dòng)子在高滲下表達(dá)都降低。
5.氧化應(yīng)激促進(jìn)正向啟動(dòng)子表達(dá),而對(duì)反向啟動(dòng)子表達(dá)沒有影響。
6. micC啟動(dòng)子對(duì)pH
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