肺結核分子流行病學研究.pdf

1、目的：本研究旨在尋找肺結核的遺傳易感位點，探索宿主遺傳因素差異對肺結核發(fā)病的影響，為肺結核的預防和藥物研發(fā)提供理論依據。
　　方法：1、對1218名漢族居民進行病例對照研究，其中病例組600例，對照組618例。進行流行病學調查和生化指標檢查。用血液基因組DNA提取試劑盒提取DNA。運用限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈反應（restriction fragment length polymorphism–polymerase chain

2、 reaction，PCR-RFLP）技術檢測CISH基因rs2239751和rs622502的基因多態(tài)性，探索CISH基因與中國漢族人群肺結核的關聯性。
　　2、驗證肺結核 GWAS中rs2057178和rs4331426在中國漢族人群中是否與肺結核相關。運用Pub med、Embase、中國生物醫(yī)學文獻、中國知網和萬方數據庫，系統(tǒng)檢索2000年到2014年3月1日之間發(fā)表的研究rs2057178多態(tài)性或rs4331426多態(tài)性

3、與肺結核關系的中英文文獻，采用Stata version11.0軟件進行Meta分析。
　　結果：1、病例組平均年齡41.03±16.26歲；對照組平均年齡43.26±17.26歲。差異無統(tǒng)計學意義，P>0.05。病例組痰樣本涂片陽性率為29.7％。胸片 X線異常率為99.0%?？ń槊缃臃N率31.2%。
　　2、CISH基因的rs2239751和 rs622502等位基因分布均符合Hardy-Weinberg（H-W）遺傳平

4、衡定律，表明抽樣方法可靠，研究樣本的群體代表性較好。
　　3、rs4331426和 rs2057178等位基因分布均符合 Hardy-Weinberg（H-W）遺傳平衡定律，表明抽樣方法可靠，研究樣本的群體代表性較好。
　　4、CISH基因rs2239751位點多態(tài)性與肺結核相關性研究中，rs2239751位點基因型和等位基因分布在兩組間差異有統(tǒng)計學意義，P值分別為0.02和0.01，并且攜帶C等位基因個體患肺結核的風險是攜

5、帶A等位基因的個體1.16倍（OR95%CI=1.03-1.29，P=0.01）。
　　5、CISH基因rs622502位點多態(tài)性與肺結核相關性研究中，rs622502位點基因型和等位基因分布在兩組間差異均無統(tǒng)計學意義，P>0.05。
　　6、驗證肺結核 GWAS中 rs4331426位點在漢族人群中是否與肺結核相關研究中，rs4331426基因型頻率在病例組和對照組中差異無統(tǒng)計學意義，P>0.05。對基因分型結果按性別，年

6、齡和涂片情況進行分層，仍然顯示 rs4331426基因型頻率在病例組和對照組中差異無統(tǒng)計學意義，P>0.05。
　　7、驗證肺結核 GWAS中 rs2057178位點在漢族人群中是否與肺結核相關研究中，rs2057178基因型頻率在病例組和對照組中差異無統(tǒng)計學意義，P>0.05。對基因分型結果按性別，年齡和涂片情況進行分層，仍然顯示 rs2057178基因型頻率在病例組和對照組中差異無統(tǒng)計學意義，P>0.05。
　　8、rs

7、4331426的Meta分析包括研究對象16325人，其中病例組6176人，對照組10149人。病例組和對照組中 G等位基因的頻率分別為36.8%和34.0%。非洲組的異質性檢驗無統(tǒng)計學意義，因此選用PetoMantel-Haenszel method固定效應模型進行數據合并計算OR；亞洲組和總體的異質性差異有統(tǒng)計學意義，P<0.1，因此選用Dersimonian Laird method隨機效應模型進行數據合并計算OR值。Meta分析

8、結果顯示rs4331426在非洲人群中研究的合并 OR值為1.18，95%CI為1.11-1.25；亞洲人群研究的合并 OR值為0.85，95%CI為0.59-1.23；總體合并 OR值為1.12，95%CI為1.02-1.23。顯著性檢驗 Z值為4.84，P﹤0.0001，差異具有統(tǒng)計學意義。漏斗圖和Egger’s-test結果顯示此次Meta分析存在發(fā)表偏倚的可能性較小。
　　9、rs2057178的Meta分析包括研究對象2

9、3897人，其中病例組9421人，對照組14476人。病例組和對照組中 T等位基因的頻率分別為15.6%和18.2%。各研究間的異質性檢驗無統(tǒng)計學意義，因此選用PetoMantel-Haenszel method固定效應模型計算合并OR值。Meta分析結果顯示rs2057178合并OR值為1.21，95%CI為1.15-1.28。顯著性檢驗Z值為6.90，P﹤0.0001，差異具有統(tǒng)計學意義。漏斗圖和Egger’s-test結果顯示此次

10、Meta分析存在發(fā)表偏倚的可能性較小。
　　結論：1、在漢族人群中 rs2239751位點多態(tài)性可能是肺結核的危險因素之一。rs622502位點多態(tài)性可能與肺結核無關。
　　2、在漢族人群中，經驗證rs2057178和rs4331426位點多態(tài)性可能與肺結核無關。即使排除性別，年齡和涂片情況等混雜因素，rs2057178和rs4331426位點多態(tài)性可能與肺結核無關。
　　3、rs4331426在非洲人群中可能是肺結核