GBM強(qiáng)化與壞死的比例(C∶N)與信號(hào)傳導(dǎo)通路相關(guān)性的研究.pdf

1、目的: 探討多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤（GBM）的磁共振（magnetic resource imaging，MRI）增強(qiáng)圖像特征中強(qiáng)化與壞死比例的高低與腫瘤信號(hào)傳導(dǎo)通路之間的相關(guān)性。
　　 方法: 收集徐醫(yī)附院病理證實(shí)為WHO Ⅳ級(jí)的GBM（C:N）的腫瘤標(biāo)本6例及磁共振圖像，腫瘤標(biāo)本取出后立即投入液氮中保存。采用Unizol法分別提取總RNA，經(jīng)驗(yàn)證RNA沒(méi)有降解后經(jīng)純化后制備成cRNA與illumina芯片雜交，通過(guò)FDR法以及基

2、因芯片的雙倍信號(hào)為雙重標(biāo)準(zhǔn)篩選出腫瘤差異表達(dá)基因。以C:N（≤1.0、1.0-3.0、≥3.0）比例為秩次，基因表達(dá)高低為秩次，通過(guò)Spearman等級(jí)相關(guān)分析C:N與差異基因表達(dá)的相關(guān)性，尋找隨C:N比例增高而增高或降低的相關(guān)基因，將實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與信號(hào)傳導(dǎo)通路的生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)KEGG等數(shù)據(jù)庫(kù)相連接，行Pathway分析。
　　 結(jié)果:
　　 1、通過(guò)Spearman等級(jí)相關(guān)分析，各從其中挑選9條基因，C:N比例與下列幾個(gè)基因

3、呈正相關(guān)關(guān)系：G1-S-specific cyclin E、Cytoplasmic nuclear factor of activated T cells、EGFR、IGFBP-1、 OX40 ligand 、Cysteine protease 、Endothelin receptor type B 、Nuclear factor I–X、 Cyclin D2。
　　 2、C:N比例與下列幾個(gè)基因呈負(fù)相關(guān)關(guān)系：Ras-relat

4、ed protein RAB3A、DNAse I-like、Akt、DNA ligase IV、Estrogen Sulfotransferase、Transforming growth factor-α、Muscle-specific DNAse I-like、Ephrin type A receptor 1、Inhibitor DNA binding- 4。
　　 3、通過(guò)聯(lián)系文獻(xiàn)及數(shù)據(jù)庫(kù)，EGFR signal pathw

5、ay 的基因表達(dá)與C:N的比例成正相關(guān)關(guān)系。Ras-raf signal pathway、PI3K-Akt-NF-κBsignal pathway的基因表達(dá)與C:N的比例成負(fù)相關(guān)關(guān)系。
　　 結(jié)論:
　　 1、GBM實(shí)質(zhì)與壞死比例(C:N)與腫瘤的EGFR信號(hào)傳導(dǎo)通路成正相關(guān)關(guān)系，當(dāng)C:N比例較高時(shí)針對(duì)EGFR信號(hào)傳導(dǎo)通路的個(gè)體化治療可能能改善預(yù)后。
　　 2、GBM實(shí)質(zhì)與壞死比例(C:N)與細(xì)胞內(nèi)Ras，PI3