廣西豬瘟病毒不同來源株的E2基因的克隆和序列分析.pdf

1、本研究采用RT-PCR技術對來自廣西不同地區(qū)的豬流產(chǎn)胎兒與死胎82份、新生仔豬33份和老母豬白細胞172份進行豬瘟病毒檢測，結果共有9份為陽性，其中死胎及流產(chǎn)胎兒4份、新生仔豬3份和母豬白細胞2份，從陽性病料中選取6份進行豬瘟病毒E2基因的克隆、測序，得到長度為1119核苷酸的目的基因片段。將這些陽性材料接種于易感細胞PK-15，經(jīng)過三代盲傳，用RT-PCR可檢測到GXGZ02、GXXJCl和GXXJBl材料所接種的細胞為豬瘟陽性。

2、 應用DNAstar序列分析軟件對所測定的6個毒株與已知序列的HCLV、Shimen等毒株的相應片段進行同源性分析比較。結果顯示，GXGZ02株與HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分別為82.3％和84.2％，其余5株與HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分別為96.8％～97.3％和94.3％～94.9％，推定的氨基酸同源性分別為89.8％～96.4％和91.2％～94.5％。除GXGZ02株，其余5株毒株之間核苷酸和推定的

3、氨基酸同源性分別為99.1％～99.6[％]和98.4％～99.2％。6個廣西毒株E2基因的所有Cys位點都沒變，可推測豬瘟病毒E2蛋白在抗原結構方面依然保持很高的穩(wěn)定性。與石門毒株、兔化弱毒疫苗株相比，廣西毒株在具有中和特性的B、C區(qū)域內(nèi)723和724氨基酸位點發(fā)生了變異。 把6個廣西毒株與國內(nèi)外已發(fā)表的豬瘟病毒相應序列進行比較，并建立了遺傳進化樹。該遺傳樹主要分為兩大群和一個另類，除GXGZ02株屬于基因Ⅱ群外，其余五株皆屬