大腸癌化療敏感蛋白標(biāo)記分子hn RNP K及腸癌相關(guān)miRNA的篩選及基礎(chǔ)應(yīng)用研究.pdf

1、上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文大腸癌化療敏感蛋白標(biāo)記分子hnRNPK及腸癌相關(guān)miRNA的篩選及基礎(chǔ)應(yīng)用研究姓名：張鵬申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：外科學(xué)指導(dǎo)教師：秦環(huán)龍201205(LoVo、SW480、HT29、Caco2)、人胚胎干細(xì)胞(huESC17)和結(jié)腸正常上皮粘膜細(xì)胞(NCM460)中篩選規(guī)律性差異表達(dá)microRNA。通過microRNA表達(dá)譜分析，并利用RTPCR證實(shí)其與大腸癌轉(zhuǎn)移潛能相關(guān)的胎源性miRNA26b，對胎源性的mic

2、roRNA進(jìn)行組織學(xué)和細(xì)胞學(xué)驗(yàn)證，并應(yīng)用生物信息學(xué)分析其潛在的靶標(biāo)及功能。(4)利用microRNA基因表達(dá)譜芯片分別從大腸癌四種細(xì)胞系(LoVo、S、M80、HT29、Caco2)中篩選規(guī)律性差異表達(dá)microRNA。通過microRNA表達(dá)譜分析，并利用RTPCR證實(shí)與大腸癌轉(zhuǎn)移潛能相關(guān)的miRNA221，對microRNA進(jìn)行組織學(xué)和細(xì)胞學(xué)驗(yàn)證，并應(yīng)用生物信息學(xué)分析其潛在的靶標(biāo)及功能。結(jié)果：(1)細(xì)胞水平蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)：5FU

3、作用前后，大腸癌腫瘤細(xì)胞的蛋白表達(dá)譜有顯著不同，且不同惡性程度的細(xì)胞具有不同的蛋白表達(dá)趨勢變化，通過質(zhì)譜鑒定和分析，腸癌細(xì)胞對化療藥物作用所產(chǎn)生的hnRNPK、PDI兩種蛋白表達(dá)趨勢及量的規(guī)律性改變，可作為大腸癌化療療效及化療反應(yīng)的客觀指標(biāo)指導(dǎo)臨床用藥；(2)miRNA全譜及基因表達(dá)譜分析，利用miRNA表達(dá)趨勢的顯著性STC分析及多重比較檢驗(yàn)進(jìn)行樣本的差異基因篩選發(fā)現(xiàn)大腸癌特異性的規(guī)律性表達(dá)的差異miRNA：hsa1et7i；(3)通