病理性近視的家系研究和基因的初步定位.pdf

1、病理性近視是以眼軸極度延長引起高度近視性屈光不正為主要特點并伴有后部鞏膜變薄、脈絡(luò)膜萎縮和視網(wǎng)膜變性的常見遺傳性致盲眼病.該研究通過對病理性近視的家系研究和基因組掃描,探討中國病理性近視的遺傳模式,確定致病基因在基因組中的位置.該研究收集了江、浙、滬、皖、豫人群中病理性近視家系90個共1822人,每個家系三代以內(nèi)有2人以上發(fā)病,患者共401人.調(diào)查方法以家訪為主,直接檢查并確定患者,或通過先證者對家系進行回顧性調(diào)查,記錄家系圖.簡單分離

2、分析:應(yīng)用先驗法、最大似然值法、Smith無偏分析及SEGRAN-B軟件進行擬合優(yōu)度卡方檢驗,比較實際分離比與理論分離比的符合程度或直接估計分離比(p),從而確定所收集家系的遺傳模式.復(fù)合分離分析:運用SAGE-REGD軟件進行孟德爾遺傳模型(主基因、顯性、隱性、共顯性)和非孟德爾遺傳模型(非傳遞、環(huán)境、一般)的擬合.共篩選出核心家系169個,根據(jù)婚配類型將病理性近視家系分為A*N和N*N兩類.簡單分離分析:先驗法:假定A*N家系p=0

3、.5,p>0.05,N*N家系p=0.25,P>0.05.最大似然值法:估算N*N家系p=0.282±0.00191.Smith無偏分析:假定A*N家系p=0.5,P>0.05.SEGRAN-B:A*N婚配的家系是常染色體顯性遺傳,分離比0.6033,散發(fā)概率為13.8％,N*N婚配的家系是常染色體隱性遺傳,分離比0.235245,散發(fā)概率為16.3％,但不排除顯性遺傳的可能.復(fù)合分離分析:接受孟德爾遺傳的顯性、隱性、共顯性和主基因模型

4、,AIC值共顯性模型最小,可判定為孟德爾共顯性遺傳.對其中28個家系進行連鎖分析,每人抽靜脈血5ml,提取基因組DNA;選取覆蓋全基因組的330對高度雜合的微衛(wèi)星DNA引物,多重PCR反應(yīng)后,在ABI377DNA測序儀上進行聚丙烯酰胺凝膠電泳,用Genescan2.0和Genetyper1.1軟件確定微衛(wèi)星長度,建立家系的微衛(wèi)星標記遺傳信息數(shù)據(jù)庫;以常染色體顯性遺傳為模式,基因頻率0.0133和外顯率100％的條件下,運用Linkage

5、軟件進行二點連鎖分析,運用Genehunter軟件進行多點連鎖分析,Cyrillic軟件構(gòu)建單倍型.MP1家系最大Lods1.76出現(xiàn)在D15S1010、D15S1007、D15S1042(θ=0.00),進一步單倍型分析將該位點定位于D15S1019到D15S146之間約12cM區(qū)間內(nèi);NPL值最大5.16,P=0.0039,也位于這一區(qū)域.其它家系中未發(fā)現(xiàn)連鎖位點.所有家系均未發(fā)現(xiàn)與已知高度近視位點18p11.31、12q21-23