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文檔簡介
1、奶山羊泌乳性狀的遺傳力較低,采用常規(guī)育種手段雖使其獲得了一定的遺傳進(jìn)展,但進(jìn)展較為緩慢,故尋找主效遺傳標(biāo)記對提高嶗山奶山羊的泌乳性能是十分必要的。本研究分析ACACA基因啟動子PⅢ和SCD基因外顯子3及側(cè)翼序列的多態(tài)性及其對泌乳性狀的影響,探討與嶗山奶山羊泌乳性狀相關(guān)聯(lián)的分子遺傳標(biāo)記,為嶗山奶山羊的品種選育提供分子依據(jù)。本研究以174只嶗山奶山羊泌乳母羊作為研究對象,利用PCR-DHPLC技術(shù)和直接測序法相結(jié)合檢測ACACA基因啟動子P
2、Ⅲ序列多態(tài)性;用PCR產(chǎn)物直接測序法檢測SCD基因外顯子3及側(cè)翼序列多態(tài)性;用Popgen3.2軟件分析多態(tài)性位點的遺傳多態(tài)性;用SAS9.2軟件分析體尺、體重指標(biāo)與泌乳性狀間的相關(guān)性以及基因多態(tài)性與泌乳性狀間的關(guān)聯(lián)效應(yīng)。結(jié)果表明:
⑴在ACACA基因啟動子PⅢ部分序列中檢測到3個SNPs,即第1206位的B/D,1255位的A/C和1322位的M/N,其等位基因和基因型頻率在種羊場(F)和農(nóng)戶(P)兩個群體中分布不均衡,
3、但均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)。在SCD基因外顯子3及側(cè)翼區(qū)檢測到4個SNPs,即E315 E/e、E368H/h,內(nèi)含子3的I346 R/r和 I355Q/q,其等位基因和基因型頻率在樣本群中均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)。其中E315 E/e和I355 Q/q的分布情況一致,呈緊密連鎖關(guān)系。
⑵體重、體高和體長與各乳成分呈顯著或極顯著負(fù)相關(guān),體長與產(chǎn)奶量呈顯著正
4、相關(guān),體重和胸圍與產(chǎn)奶量呈極顯著正相關(guān)。
⑶在整個樣本群體中,大部分泌乳性狀均存在顯著的場別效應(yīng)(P<0.01或P<0.05),而ACACA基因啟動子PⅢ所有位點的基因型效應(yīng)均不顯著(P>0.05),在F群體的1206位點上,等位基因B為乳蛋白率、乳糖率、非脂肪物性狀的有利等位基因,BB基因型與BD基因型的乳蛋白率和乳糖率性狀差異極顯著(P<0.01),非脂肪物和乳密度性狀差異顯著(P<0.05),BB基因型與BD基因型,
5、乳蛋白率、乳糖率和非脂肪物性狀均存在顯著的等位基因替代效應(yīng)(P<0.05);而在P群體中,兩種基因型之間的所有性狀則差異不顯著(P>0.05)。在F群體的1322位點上,等位基因N為乳糖率的有利等位基因,為300d產(chǎn)奶量的不利等位基因,MN基因型與MM基因型的300d產(chǎn)奶量和乳糖率性狀差異顯著(P<0.01或P<0.05),其等位基因替代效應(yīng)分別為-52.22kg和0.12%(P<0.01);而在P群體中,等位基因M為乳蛋白率、乳糖率、
6、非脂肪物、乳密度的有利等位基因,乳糖率和非脂肪物的等位基因替代效應(yīng)分別為-0.25%和-0.44%(P<0.05)。
⑷SCD基因E315和I355位點的EE/QQ基因型與基因型ee/qq的所有乳成分性狀差異顯著(P<0.05)或極顯著(P<0.01),EE/QQ與Ee/Qq基因型的乳蛋白率、乳密度差異顯著(P<0.05),等位基因E/Q為乳成分性狀的有利等位基因;各乳成分性狀的基因加性效應(yīng)極顯著(P<0.01),顯性效應(yīng)
7、不顯著(P>0.05)。E368位點hh基因型與HH和Hh基因型的所有乳成分性狀差異顯著(P<0.05)或極顯著(P<0.01),等位基因h為乳成分性狀的有利等位基因;所有乳成分的基因加性效應(yīng)和顯性效應(yīng)極顯著(P<0.01)。I346位點rr基因型的300d產(chǎn)奶量極顯著(P<0.01)高于RR基因型,等位基因r為300d產(chǎn)奶量的有利等位基因,但其對乳成分性狀的影響不顯著(P>0.05)。在不同試驗群體中分析SCD基因多態(tài)性與泌乳性狀的關(guān)
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