德州驢H-FABP基因克隆及其mRNA在不同組織部位的表達差異.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、在驢的育種中肉質(zhì)性狀是一個重要的標(biāo)志性指標(biāo),其中的一個重要的因素就是驢肉肌內(nèi)脂肪的含量。脂肪是影響肉質(zhì)性狀的一個比較重要的因素,尤其是肌內(nèi)脂肪被認(rèn)為與肉質(zhì)及口感呈正相關(guān),會影響肉的嫩度、剪切力、風(fēng)味和多汁性等。心臟脂肪酸結(jié)合蛋白(H-FABP)是脂肪酸結(jié)合蛋白家族中最普遍的一種類型,主要存在于心肌、骨骼肌和乳腺等對脂肪酸高度需求的組織中,其主要作用是防止細(xì)胞內(nèi)堆積游離脂肪酸。目前,對多種畜禽的研究表明,H-FABP基因可作為影響畜禽肌內(nèi)

2、脂肪含量和肉質(zhì)性狀的侯選基因。盡管近十年來人們通過不斷的選育來選擇產(chǎn)肉率高,生長發(fā)育速度快的新品種,卻忽視了肌內(nèi)脂肪含量的選育。有研究表明驢肉肌內(nèi)脂肪的含量應(yīng)該在2%-3%較為合適,而德州驢和華北驢的肌肉含脂率分別為5.05%和5.31%,均超過此指標(biāo)。本試驗對德州驢H-FABP基因進行克隆測序,獲得該基因的全序列;并分析該基因mRNA在不同組織部位的表達差異。以期為進一步開展德州驢H-FABP基因與其肉質(zhì)性狀的相關(guān)分析,進行分子標(biāo)記輔

3、助選擇、基因定位、表達以及德州驢與其它物種間系統(tǒng)進化研究提供一定的理論基礎(chǔ)。
   本研究對德州驢心臟脂肪酸結(jié)合蛋白(H-FABP)基因進行了克隆測序,并與GenBank中11個物種相應(yīng)基因編碼區(qū)核苷酸序列、氨基酸序列進行了比對分析。結(jié)果表明,德州驢H-FABP基因由4個外顯子和3個內(nèi)含子組成,外顯子1、外顯子2、外顯子3和外顯子4大小分別為73、173、102和57bp,內(nèi)含子1、內(nèi)含子2和內(nèi)含子3大小分別為3500、1981

4、和1499bp。CDS序列全長為405bp,前體氨基酸數(shù)為134個。物種間在該基因核苷酸序列上有較高的保守性。通過最小進化法(ME法)、鄰接法(NJ法)和非加權(quán)組平均法(UPGMA法)用H-FABP基因編碼區(qū)核苷酸序列構(gòu)建的物種間分子系統(tǒng)進化樹,結(jié)果表明,3種方法構(gòu)建的物種間分子系統(tǒng)進化樹基本一致。并且三種分子進化樹結(jié)果與動物學(xué)分類一致,表明H-FABP基因適合于構(gòu)建不同物種間的系統(tǒng)進化樹。
   德州驢H-FABPmRNA在心

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