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文檔簡介
1、阿爾茲海默癥(Alzheimer's disease,AD)是一種神經(jīng)退行性疾病,淀粉樣多肽(amyloid beta peptide,Aβ)的聚集是AD的致病機理之一,Aβ聚集以及抑制劑抑制Aβ聚集的分子機理還不是很清楚。本文利用分子動力學模擬、MM/PBSA自由能分解方法對Aβ聚集以及噬菌體展示技術篩選獲得的結(jié)合蛋白質(zhì)ZAβ穩(wěn)定Aβ聚集的分子機制進行了研究。
首先以Aβ17-42五聚體為研究目標,利用分子動力學模擬和自
2、由能分解方法解析了Aβ聚集的關鍵因素。結(jié)果表明疏水性相互作用和氫鍵是Aβ聚集的主要推動力。通過自由能分解得出V18、F19、F20、E22、D23、V24、K28、L34、M35、V36、V39、V40和141是Aβ聚集的關鍵氨基酸。相鄰單體間相同位置的關鍵氨基酸殘基主要以疏水性相互作用為主,但與鄰近位置的關鍵氨基酸殘基卻以氫鍵作用為主。此外,D23和K28形成鏈間鹽橋?qū)β的聚集也起到重要的作用。
以ZAβ與Aβ16-4
3、0復合物為研究對象,解析了抑制劑ZAβ穩(wěn)定Aβ16-40的分子機理。結(jié)果表明,ZAβ主要與Aβ16-40的關鍵氨基酸殘基F19、F20、A21、E22、D23、K28、L34、V36、V40發(fā)生作用。ZAβ主要通過疏水性相互作用和靜電作用穩(wěn)定Aβ16-40,從而抑制它們聚集。自由能分解結(jié)果表明ZAβ穩(wěn)定Aβ16-40的關鍵氨基酸殘基為E15、116、V17、Y18、L19、P20、N21、L22。相反,α-helix與Aβ16-40的作
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