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文檔簡介
1、第一部分遺傳性高鈣尿結(jié)石形成大鼠腎臟 miRNA-mRNA表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
目的:全面了解遺傳性高鈣尿結(jié)石形成大鼠腎臟miRNA及mRNA的表達(dá)變化及其相互作用關(guān)系。
方法:采用高通量miRNA及mRNA生物芯片技術(shù),尋找出在遺傳性高鈣尿結(jié)石形成大鼠(GHS大鼠)與Sprague-Dawley大鼠(SD大鼠)腎臟差異表達(dá)的miRNA及mRNA。通過miRanda數(shù)據(jù)庫,預(yù)測miRNA的靶基因,選取預(yù)測的靶基因與實(shí)際表達(dá)差
2、異的交集基因進(jìn)行生物信息學(xué)的分析。通過GO分析和KEGGpathways分析尋找差異基因可能富集的功能和信號通路,并最終根據(jù)差異miRNA和mRNA構(gòu)建出miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞信號通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(signal-net)。
結(jié)果:通過生物芯片檢測,共發(fā)現(xiàn)2418個(gè)在GHS大鼠和SD大鼠腎臟內(nèi)差異表達(dá)的mRNA和19個(gè)差異表達(dá)的miRNA。選取miRNA的預(yù)測靶基因和2418個(gè)差異表達(dá)基因的交集做GO和KEGG path
3、ways分析,共得到703個(gè)明顯富集的GO terms(包括417個(gè)上調(diào)和286個(gè)下調(diào))以及83個(gè)明顯富集的pathways(包括75個(gè)上調(diào)和18個(gè)下調(diào))。成功構(gòu)建miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),通過網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn),rno-miR-674-5p, rno-miR-672-5p, rno-miR-138-5p and rno-miR-21-3p可能是調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的核心,而Sema5a, Lpin2, Gcnt1, Masp1, Olr1和Traf
4、3等基因在網(wǎng)絡(luò)中有最高的連接度。此外,還成功構(gòu)建差異表達(dá)的細(xì)胞信號通路網(wǎng)絡(luò),并發(fā)現(xiàn)NFκB家族分子在特發(fā)性高鈣尿大鼠腎臟細(xì)胞信號通路調(diào)節(jié)中發(fā)揮核心作用。
結(jié)論:本研究成功鑒定了GHS大鼠腎臟內(nèi)差異表達(dá)的miRNA和mRNA,并構(gòu)建了GHS大鼠腎臟miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和信號通路網(wǎng)絡(luò),為特發(fā)性高鈣尿結(jié)石病腎臟基因水平發(fā)生的改變提供了一個(gè)全局觀;同時(shí)也發(fā)現(xiàn)miRNA可能在該病病理生理過程中發(fā)揮重要作用,而NFκB信號通路及其
5、下游分子的改變則是該病的核心。本項(xiàng)目為今后關(guān)于特發(fā)性高鈣尿結(jié)石病的深入研究提供了方向。
第二部分 Ca2+激活腎小管上皮細(xì)胞 ROS/NFκB信號通路促進(jìn)細(xì)胞黏附分子表達(dá)
目的:探討高鈣尿環(huán)境對腎小管上皮細(xì)胞表面黏附分子表達(dá)和草酸鈣晶體黏附的影響及其作用機(jī)制
方法:取GHS大鼠及SD大鼠腎臟組織,采用qRT-PCR,western blot,免疫組化檢測大鼠腎臟組織細(xì)胞內(nèi)黏附分子 ICAM-1,VCAM-1
6、及 IL-6的表達(dá)水平,用ELISA方法檢測大鼠血漿ICAM-1,VCAM-1及IL-6水平;并用western blot檢測NFκB相關(guān)分子p65和IκB表達(dá)水平和磷酸化水平;腹腔注射乙醛酸誘導(dǎo)大鼠腎臟成石,von-kossal染色觀察草酸鈣晶體在腎小管管腔內(nèi)的黏附情況。酶消化貼壁法培養(yǎng)GHS大鼠原代腎小管上皮細(xì)胞,并用流式細(xì)胞術(shù)鑒定細(xì)胞表面免疫標(biāo)記CK-18,CK-19及E-cadherin。用Ca2+處理GHS大鼠原代腎小管上皮細(xì)
7、胞和NRK-52E細(xì)胞,鈣離子探針觀察Ca2+內(nèi)流情況;活性氧(ROS)探針觀察細(xì)胞內(nèi)ROS生成情況;qRT-PCR,western blot檢測黏附分子表達(dá)水平和NFκB相關(guān)分子表達(dá)水平和磷酸化水平;免疫熒光檢測p65表達(dá)分布變化;草酸鈣懸液孵育細(xì)胞,觀察細(xì)胞表面晶體黏附情況;透射電鏡觀察Ca2+處理前后細(xì)胞微結(jié)構(gòu)改變。分別用ROS清除劑NAC和NFκB核轉(zhuǎn)運(yùn)抑制劑BAY11-7082預(yù)處理細(xì)胞,之后用Ca2+處理細(xì)胞,觀察細(xì)胞內(nèi)上述
8、指標(biāo)變化,旨在證實(shí)細(xì)胞內(nèi)ROS生成和NFκB信號通路在Ca2+刺激誘導(dǎo)的細(xì)胞粘附分子表達(dá)和草酸鈣晶體黏附過程中的作用。
結(jié)果:GHS大鼠腎臟組織內(nèi)黏附分子ICAM-1,VCAM-1及IL-6的表達(dá)水平明顯高于普通SD大鼠,GHS血清中ICAM-1,VCAM-1及IL-6的表達(dá)也明顯高于SD大鼠;western blot檢測結(jié)果顯示,GHS大鼠腎臟組織內(nèi)p65和IκBα磷酸化水平明顯增高,乙醛酸誘導(dǎo)GHS大鼠腎小管內(nèi)草酸鈣晶體生
9、成明顯多于SD大鼠。成功培育GHS大鼠原代腎小管上皮細(xì)胞。高鈣環(huán)境可促使細(xì)胞內(nèi)Ca2+含量增加,并誘導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)ROS產(chǎn)生增加。Ca2+還能促進(jìn)細(xì)胞黏附分子表達(dá)增加,促進(jìn)NFκB信號通路相關(guān)分子p65和IκBα的磷酸化及p65的核轉(zhuǎn)運(yùn)。NAC能降低細(xì)胞內(nèi)的ROS的水平,并抑制NFκB分子的磷酸化,細(xì)胞黏附分子的表達(dá)和草酸鈣晶體在細(xì)胞表面的黏附。BAY11-7082亦可以抑制NRK-52E細(xì)胞黏附分子的表達(dá)和草酸鈣晶體在細(xì)胞表面的黏附。
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